【摘 要】
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乳腺癌是一种高度异质性的肿瘤。探索乳腺癌的发病机制和潜在的治疗靶点一直是研究的热点。研究表明,肿瘤微环境（TME）对肿瘤的发生、生长和转移起着重要的作用,其中血小板对肿瘤微环境有重要影响,在肿瘤的增殖、凋亡等方面发挥作用。免疫微环境作为肿瘤微环境的重要组成部分,相关因素的改变也影响着肿瘤的预后。而考虑到肿瘤调控的复杂性,我们从mRNA和lncRNA两条途径去研究血小板在免疫上的作用。基于TCGA数
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乳腺癌是一种高度异质性的肿瘤。探索乳腺癌的发病机制和潜在的治疗靶点一直是研究的热点。研究表明,肿瘤微环境（TME）对肿瘤的发生、生长和转移起着重要的作用,其中血小板对肿瘤微环境有重要影响,在肿瘤的增殖、凋亡等方面发挥作用。免疫微环境作为肿瘤微环境的重要组成部分,相关因素的改变也影响着肿瘤的预后。而考虑到肿瘤调控的复杂性,我们从mRNA和lncRNA两条途径去研究血小板在免疫上的作用。基于TCGA数据库BRCA患者的基因表达谱数据,通过Cox回归和WGCNA两种方法,对mRNA和lncRNA进行了筛选,最终我们基于六个mRNA（DAXX、CD79A、TANK、SERPINA3、JAK2和PIK3CA）,以及四个lncRNA（LINC01871、ELOVL2-AS1、MEF2CAS1和PCAT18）构建了风险模型,并在此基础上对TCGA-BRCA患者的免疫微环境、突变情况做了进一步的分析。结果显示,突变率最高的PIK3CA与TP53、GATA3等基因突变情况显著互斥,与MAP3K1、KMT2C、CDH1等基因在突变模式上具有一致性。而在血小板和免疫相关的6个mRNA之间,CD79A和DAXX具有显著的一致性表现。免疫微环境分析结果显示,高风险组患者的肿瘤纯度较高,免疫细胞含量总体较少,且免疫浸润细胞分析也提示各免疫细胞含量普遍降低,提示肿瘤免疫微环境是处于免疫抑制的状态。在通路分析上,GSEA分析显示,高低风险组之间的血小板和免疫功能相关通路,如凋亡、炎症反应等有所不同,例如免疫相关通路被全面抑制,符合免疫微环境的分析结果。而关于血小板和免疫相关lncRNA和mRNA之间的关系,我们使用DIANA-Lnc Base v3和miRnet数据库对两者之间可能存在的共调控micro RNA进行了分析,发现micro RNA,hsa-let-7b-5p与lncRNA和mRNA均存在相互关系,可供深入分析hsa-let-7b-5p在血小板和免疫调控中的作用以及和lncRNA、mRNA之间的相互关系。预后模型的建立,可以为血小板和免疫相关基因提供潜在的治疗靶点和预后标志物,并为乳腺癌的预后预测提供参考。
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