鱼翅是我国传统“海八珍”之一，属于高值水产加工品，伴随我国经济的发展，鱼翅消费量逐年增大，鱼翅市场上也因此浮现出诸多乱象。某些商贩将明胶等材料或者鳐类鱼翅标注为鲨鱼鱼翅进行贩卖干扰鱼翅贸易的正常进行，而不法分子捕捞濒危物种进行割取鱼翅不仅对鱼翅贸易造成了较大阻碍，也人为加重了某些鲨类的濒危程度。为了规范鱼翅市场，打击濒危物种的贸易并避免欺骗消费者现象的发生，鉴于此，进行鱼翅物种鉴别具有重要意义。传统的鱼翅鉴别主要通过感官鉴定法开展，感官鉴定法能够提供一定的鱼翅商品名分类信息，但无法提供准确的鱼翅物种来源信息。鉴于DNA条形码在水产品物种鉴定中运用广泛，准确性高等原因，本文基于DNA条形码方法进行鱼翅物种鉴别的相关研究。鱼翅为鲨鱼鱼鳍中的角质鳍条，属于致密结缔组织，细胞含量不丰富。本文中研究的鱼翅样品为市场上最为常见的明翅，即一种半加工形态鱼翅制品。此类鱼翅是经由鲨鱼鱼鳍通过褪沙（去皮），去除残肉与软骨，漂白晒干等加工步骤得到的。上述原因造成了鱼翅DNA提取的困难。为了获取能够满足条形码鉴定所需的DNA，本文针对鱼翅特性采用了发制-冻干的前处理方法进行鱼翅组织破碎，选取了Chelex-100螯合树脂法，STE法，经典CTAB法以及试剂盒纯化法用于鱼翅DNA提取效果的比较以选取最佳方法。根据比较结果，针对CTAB提取方法中的进行了多个步骤的优化与改进，提出了改良CTAB法用于鱼翅DNA提取。根据DNA浓度值/纯度值以及PCR扩增成功率，改良CTAB法能够获得较好的鱼翅DNA提取效果。为了准确进行国内水产市场中鱼翅制品的物种来源调查，本文选取了我国北方鱼翅贸易中心城市青岛及占全国鱼翅贸易总量90%以上的广东省分别进行采样。本文针对共计例107鱼翅样品进行了DNA条形码鉴别研究。除了选取COⅠ（cytochrome oxidase subunit Ⅰ）外，还着重考虑了使用16SrRNA编码基因进行鱼翅鉴别的可行性与准确性。针对鱼翅样品的物种鉴定结果显示：鱼翅的物种来源较丰富，涵盖不同鲨类10种，如尖吻鲭鲨，路氏双髻鲨，镰状真鲨，大青鲨等；基于16SrRNA序列的鉴定结果与基于COⅠ序列的鉴定结果一致。多数样本与已知物种的现有序列之间能够在聚类关系中形成单系，其中来源于灰鲭鲨属尖吻鲭鲨的鱼翅样品的存在两类聚类关系，基于两基因的聚类关系一致。而针对真鲨属不同种的鉴定结果显示，16SrRNA未能鉴别出来源于杜氏真鲨与蒂氏真鲨的鱼翅样本，进一步分析显示，这是由于NCBI中相关序列（全基因组及16S相关基因）的缺少所造成的，同时也表明基于16SrRNA在进行真鲨属不同鲨鱼物种鉴别水平上的准确性。可以得出结论，16SrRNA基因适用于常见鱼翅的物种来源鉴定。本文针对鲨鱼物种进行分析显示，存在两类双髻鲨类（路氏双髻鲨与锤头双髻鲨）为华盛顿公约附录Ⅱ中禁止国际贸易的物种，所占比例达到所检鱼翅的14.01%，上述两类鲨鱼及其相关制品属于我国二级重点保护动物，其相关贸易违反了我国现有法律条例。此外，所检鱼翅样品存在大眼长尾鲨、尖吻鲭鲨等根据红色名单划分属于“易危”类别，虽然我国现目前并没有针对此两类鲨鱼制定强制性法律要求，但世界范围的渔业管理部门已将此两类鲨鱼作为重点保护对象，应当控制其及其制品的相关贸易。鉴于上述现象，亟需基于物种水平的实施鲨鱼资源管理特别是鱼翅物种来源鉴定及管理措施，以保护濒危特种鲨鱼并维持鲨类资源可持续利用。