在生物调节途径中起重要作用的环状RNA（circRNA）在许多物种中广泛存在,它是一种环状结构的RNA分子,没有3’和5’末端,不易被RNA酶降解,通过和微小RNA或小分子蛋白质之间的互作行使生物学功能,如作为微小RNA海绵等,其中部分circRNA序列还具有较高的保守性。如今,已发现越来越多的circRNA具有翻译能力,可以通过翻译产生细胞中的蛋白质,并在生物体的生长、发育和免疫反应等生物过程中起重要作用。正确鉴定具有翻译潜能的circRNA对于进一步研究具有重要意义。但是,目前缺乏识别其翻译潜力的软件。目前,随着高通量测序技术的发展和核糖体分析技术的出现,使高灵敏度地识别circRNA的翻译能力成为可能。在此,本论文开发了一种软件,用于根据核糖体分析数据识别circRNA的翻译潜力。为了测试CircCode的性能,我们收集了来自拟南芥和人的circRNAs数据集以及他们的核糖体图谱数据作为测试。最后,我们通过使用CircCode分别发现4651个在人类中可翻译circRNA和371个在植物中可翻译circRNA并分别进行了功能富集分析。CircCode是一个基于Python 3的框架,用于翻译circRNA（circRNA）鉴定。它也是一个简单而强大的基于命令行的软件。用户只需填写给定的配置文件并运行python脚本即可获得预测的翻译circRNA。它可以高正确率地从给定的候选circRNA数据库中鉴定出具有翻译能力的circRNA。该软件目前已发布在代码仓库GitHub（https://github.com/PSSUN/CircCode）上以供科研人员免费使用。此外,对于circRNA的下游分析及其数据的可视化,本研究开发了一款基于R语言的第三方包,Rcirc’,Rcirc是一款基于R语言的,用于对circRNA进行各种下游分析,以及进行可视化的R包。在CircCode的基础上,Rcirc不仅可以实现对circRNA翻译能力的预测。还包含了 circRNA的鉴定,特征分析（包括单独特征和集合特征）等重要功能。针对具有翻译潜力的circRNA,我们对其junction位点reads的匹配情况进行了独特的可视化,这使得借助Rcirc可以清楚地看到junction位点附近所有reads的匹配情况,包括reads分布情况,reads覆盖区域的每一个碱基类型,以及起始密码子和终止密码子的高亮等。此外借助可选参数可以实现对该区域进行放大和缩小等功能,具体的使用方式被发布在Rcirc的在线使用手册网站上（rcirc-doc.readthedocs.io/en/latest/）,该 R 包同样存储在 GitHub 代码仓库中（https://github.com/PSSUN/Rcirc）。最后,基于利用CircCode鉴别出来的具有翻译能力的circRNA数据,我们建立了相关的翻译circRNA数据库TransCircDB（transcircdb.com）,其中储存了包括人,小鼠,大鼠,鸡,拟南芥和玉米,水稻等十余个物种的翻译circRNA的序列信息和位置信息,供广大科研人员下载使用,同时TransCircDB支持多种在线生物信息学分析,包括circRNA的识别,翻译能力的鉴定,成环机制的整理,测序数据比对情况的可视化等在线工具,可以直接在网页上提交数据完成常规的分析,以上所有服务均免费提供。