在我国改革开放工业化的进程中，农民工已经成为一个不容忽视、规模巨大的特殊社会群体，长期以来被排斥在城市社会保障网络之外，尤其是农民工因其职业特点而面临着巨大的疾病健康风险，却没有相应的保障机制。面对农民工社会保障权严重缺失的状况，一些地方政府相应出台了关于农民工社会保险的政策文件，但多偏重于养老保险制度的建立，医疗保障相对滞后。与此同时，深圳市从1992年开始涉足农民工医疗保险，经历了十多年的发展，于2005年创新制定了劳务工合作医疗制度，深圳的农民工医疗保障走在了改革前端。　　本文运用规范分析和实证分析相结合的方法，经过大量的文献研究、到深圳实地调查、对农民工个案访谈，对深圳的农民工医疗保障进行全面系统的剖析，进而对农民工医疗保障制度的选择建立提出政策建议。　　首先从深圳农民工疾病健康现状入手，梳理分析了深圳农民工医疗保障的发展进程。由于深圳发达的制造业，农民工已成为产业工人的主体，因职业状况而面临着巨大的工伤、疾病风险，对医疗保险的需求凸显;在此基础上，深圳的农民工医疗保险伴随着城镇职工医疗保险的改革逐步建立发展。其次，对新型的农民工合作医疗内容和制度的推行状况进行阐述。文章重点在于第三部分对深圳劳务工合作医疗制度的分析研究。从制度的价值理念、效果评估、相关性和发展性角度，对合作医疗制度进行整体评价，认为该制度体现了社会公平、医疗保险共济互助的原则，总体呈现参保人数增长迅速、满足参保人需要、基金运行效率较高的良好态势，但是也暴露出覆盖面狭窄、保障水平更待提高等问题。同时，把该制度放到全国范围，与北京、上海、成都三地的农民工医疗保险模式进行横向比较，对制度的异同及合理性进行分析。另一方面，本文通过典型个案的延展，从农民工群体对医疗保险、社会保障的认知程度和主观意识入手，来探析农民工意识要素对医疗保障制度的建立的启发。文章的第四部分，在深圳农民工医疗保险的制度分析和农民工群体的意识需求研究的基础上，提出当前应从加强政府责任、选择合适的医疗保险制度、推广社区医疗模式以及建立医疗救助制度四个方面来构建农民工医疗保障制度。　　本文的创新之处在于通过实证调查，选择从农民工个体、群体意识角度来剖析现行医疗保障制度，分析意识状态的成因，从而得出更为有效的政策建议。