基于neo4j图数据管理系统的中医常用方剂知识图谱研究

来源 :北京中医药大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:cchomonkey
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目的:本研究以中医“理、法、方、药”为理论基础,中国中医药行业高等教育“十二五”规划《方剂学》第九版教材内容为数据来源,构建中医常用方剂知识图谱,以期为方剂智能推理提供数据支持。方法:本研究分二个阶段,根据不同阶段的研究内容采用了不同的研究方法,下文将分阶段介绍研究方法。第一阶段:中医方剂的组方分析研究。本阶段以中国中医药行业高等教育“十二五”规划的《方剂学》第九版教材为蓝本,在《伤寒杂病论》辨证论治思想指导下,通过对“理、法、方、药”理论、方药剂型及煎服法、组方药物剂量等内容进行分析,从而得出方剂各组成部分之间的关系。为下一个阶段常用方剂知识图谱概念层的设计提供中医的理论依据。第二阶段:中医方剂组方的知识图谱研究。此研究阶段分为3步,如下:(1)基于领域本体七步法进行方剂知识结构整理并绘制出常用方剂知识图谱的概念层结构图;(2)运用brat语料标注工具,对《方剂学》第九版教材中的方剂知识进行标注,基于标注的方剂数据结合neo4j图数据库构建常用方剂知识图谱。其具体步骤如下:首先基于常用方剂知识图谱的结构,设计brat方剂知识标注模板。其次将《方剂学》教材全部内容转换为text电子文本上传至brat系统。依据设计的brat方剂知识标注模板开始数据标注。标注的数据将自动同步并储存于brat系统生成的ann文档,每上传一个text电子文本,系统会自动生成一个同名ann文档。最后,基于neo4j图数据管理系统中知识图谱数据结构,分析ann文件中存储的数据到neo4j图数据库的对应规则,依据此规则将数据导入neo4j图数据管理系统,以构建知识图谱。(3)通过设计数据输入概念模板、知识间关联模板,对图数据库中数据进行维护,实现数据的增、删、改、查等。结果:本研究通过对方剂组方知识进行分析,并利用领域本体“七步法”构建了常用方剂知识图谱概念层,基于此概念层结构运用brat语料标注系统对方剂知识数据进行标注。标注了实体6212个,关系6067条,属性4441个,共计16720个。将标注的数据导入neo4j图数据管理系统后,最终构建了中医常用方剂知识图谱。结论:本研究提出了一套从brat标注系统,到ann数据与知识图谱对应模板,再到数据与知识图谱转换的知识图谱构建方法,解决了以往纯手工录入费时费力的问题,提高了知识图谱的构建效率。同时,本研究所标注的数据可用于中医知识的进一步自动标注研究。在应用方面,本研究所构建的常用方剂知识图谱一方面可为名老中医传承辅助平台提供数据支持,另一方面可通过方剂知识智能推理模板,为方剂智能推理提供数据支持。
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