骨关节炎相关基因与骨质疏松的关联分析

来源 :湖南师范大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:cho159753
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的:骨质疏松症(osteoporosis,OP)和骨关节炎(osteoarthritis,OA)多发生于中老年人群,在部分老年人中,这两种病同时出现。因此,骨关节炎和骨质疏松症之间的关系复杂且相互影响。目前,通过全基因组关联分析(GWAS)已经发现了骨质疏松和骨关节炎的候选致病基因,也有研究已经鉴定了一些两个疾病的共享风险因子,但为了进一步理解两者间的相关性,还需要发现更多的多效基因。本研究旨在探究骨关节炎相关基因是否与骨密度关联,从而鉴定同时影响骨关节炎和骨质疏松的多效基因。研究方法及结果:我们在通过公共数据库PheGenI和Pubmed选择了102个已鉴定的与骨关节炎相关的SNPs(多重检验之后P<0.05),然后在7个样本中检测这些SNPs是否与骨密度相关,经过多重检验校正之后,共发现2个骨关节炎相关的SNP(LRP5rs3736228和SP7 rs2016266)与骨质疏松性状相关联,P值分别为:5.99E-05和2.53E-04,eQTL分析发现rs3736228具有eQTL效应,并且对其eQTL基因MTL5和CPT1A具有顺式调节的作用。使用公共数据库GEO中表达谱数据进行差异表达分析,发现GSE13850这一数据集中MTL5和CPT1A在高低骨密度组单核细胞里存在差异表达,t检验P值分别为:1.56E-02和4.83E-02。对rs3736228进行功能预测发现该位点位于错义突变区域,并且位点所编码的氨基酸经错义突变后,由丙氨酸(A)变成了缬氨酸(V),由此推测,rs3736228位点可能通过改变其编码的氨基酸的种类,从而改变蛋白质的结构,来影响甚至是诱发骨质疏松症,对蛋白质进行结构预测也发现错义突变后的蛋白质二级结构发生了变化,更加证明了这一推论。另外,rs3736228还可以通过调节其eQTL基因CPT1A和MTL5的表达进而影响骨质疏松。因此,LRP5和SP7基因是同时影响骨关节炎和骨质疏松的多效基因。基于在线公共数据库数据的信息挖掘,利用整合分析的方法去探究疾病相关SNPs和疾病间的分子功能机制,为进一步研究疾病的致病原因提供了更多证据。
其他文献
目的:探讨超声波在腰椎间盘突出症临床诊断中的效果,进而分析超声波对腰椎间盘突出症治疗方面的价值,为相关的医疗工作人员在诊治腰椎间盘突出症时提供一定的超声波理论支持和
亲历污水处理厂  虽然与暴雨擦身而过,但北京入伏前还是淅淅沥沥的连着下了几天雨。一片绿色草坪和被雨水洗刷过的平坦路面,令空气都新鲜了起来。如果不是亲眼所见,记者一直认为污水处理厂是个难以接近的地方,蚊蝇密布,弥漫令人呼吸不畅的气味。然而,眼前的污水厂更像是一个绿化很好的园地,还能看到蜻蜓的曼妙身姿。  位于北京市海淀区的清河污水处理厂和再生水厂,占地面积为30.1公顷。一二期工程总规模为每日处理污
期刊
研究背景骨缺损的修复一直以来是临床工作中关注的焦点,口腔种植修复中,也常常会面临骨量不足的问题,而获得和长期维持种植体骨结合最重要的先决条件是种植位点存在充足的健
初中阶段的英语学习中需要将读写结合起来开展教学。阅读是获得信息,积累知识的重要环节,写作是学生输出自己所学,能够运用英语表情达意的一种重要的方式。写作教学的有效开
目的:1.制备具有一定压缩强度的柠檬酸钙骨水泥。2.探讨柠檬酸钙骨水泥的理化特性。3.检测骨水泥的生物安全性及柠檬酸在骨水泥中发挥的成骨效应。方法:1.将柠檬酸粉末及柠檬
在潍坊,能够永垂青史的人物,曹鸿勋算一个。这不仅因为他是隋唐科举制度以来潍县出的第一个状元,也因为他为官清正。在文风浓郁的潍坊人眼里,还有更被看重的一面,那就是他的
研究背景及目的脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)是指因各种致病因素(外伤、炎症、肿瘤等)引起脊髓损害,造成损害平面以下的脊髓神经功能(运动、感觉、括约肌及自主神经功能
<正> 人与自然关系学说,是中医理论体系中的重要内容。古代医家视天地为一大宇宙,人体为一小宇宙,谓大小宇宙息息相通,《灵枢·邪客篇》称之为“人与天地相应”。当前要继
本文以小县城人居环境为切入点,首先讨论小县城人居环境的空间特点,然后以光山县小潢河为例,分析小潢河两岸人居环境的空间问题、人居环境目标,并挖掘河两岸人居环境基底条件
宫颈癌是女性中第四位高发的恶性肿瘤,占妇女癌症死亡的第四位([1])。宫颈癌的发生、发展需要一个漫长的过程,从宫颈上皮内瘤变发展到宫颈癌大约需要1020年([2])。实践证明,宫颈