【摘 要】
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根据综合选择指数进行选种选配是畜禽选择中最有效的方法之一。随着育种学的发展,世界各国的育种学者发现单纯以产奶性状做为育种目标对奶牛的选育,会导致奶牛的繁殖等性能下降等问题。因此,育种学家提出了“平衡育种”的理念,越来越多的功能性状被纳入世界各国的综合选择指数中。我国2020年修订的荷斯坦牛综合选择指数（CPI）纳入了乳脂量、乳蛋白量、体细胞评分、肢蹄评分、泌乳系统评分和体型总分,尚未考虑繁殖等功能
【基金项目】
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新疆维吾尔自治区重大科技专项（项目编号:2020A01001-1）； 2021级自治区研究生科研创新项目，新疆地区荷斯坦牛综合选择指数制定及基因组选择的应用，（项目编号:XJ2021G178）；
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根据综合选择指数进行选种选配是畜禽选择中最有效的方法之一。随着育种学的发展,世界各国的育种学者发现单纯以产奶性状做为育种目标对奶牛的选育,会导致奶牛的繁殖等性能下降等问题。因此,育种学家提出了“平衡育种”的理念,越来越多的功能性状被纳入世界各国的综合选择指数中。我国2020年修订的荷斯坦牛综合选择指数（CPI）纳入了乳脂量、乳蛋白量、体细胞评分、肢蹄评分、泌乳系统评分和体型总分,尚未考虑繁殖等功能性状。本研究参考我国现行的综合选择指数,以新疆呼图壁种牛场下属六个分牧场1985～2021年配种记录和产犊记录、2008～2021年DHI测定记录和2021年体型外貌鉴定记录为基础,将整理获得的305 d产奶量、乳脂率、乳蛋白率和体细胞数作为产奶性状;产犊间隔和初产月龄为繁殖性状;肢蹄评分、泌乳系统评分和体型总分为体型性状。利用SAS 8.1软件分析非遗传因素对各性状的影响,对各性状有显著影响的非遗传因素做为固定效应用于后续遗传评估模型中,利用DMU软件配合动物模型和重复力模型估计各性状方差组分,计算遗传参数和估计育种值。利用差额法计算各目标性状边际效益,根据各性状边际效益和遗传标准差构建了新疆地区荷斯坦牛综合选择指数。利用Illumina公司100K SNP芯片对357头后备母牛进行基因分型,利用一步法和GCPI2计算出357头后备母牛产奶性状基因组育种值。主要结果如下:（1）新疆地区荷斯坦牛产奶性状305 d产奶量、乳脂率、乳蛋白率和体细胞评分遗传力估计值分别为0.19、0.16、0.20和0.06,重复力分别为0.42、0.23、0.20和0.10;繁殖性状产犊间隔和初产月龄遗传力分别为0.06和0.28,产犊间隔重复力为0.14;体型性状中肢蹄评分、泌乳系统评分和体型总分遗传力分别为0.04、0.31和0.07。（2）根据牧场生产管理、市场经济参数以及目标性状遗传参数估计,确定上述9个性状为新疆地区荷斯坦牛育种目标性状,并计算各性状边际效益值,结合各性状遗传标准差计算各性状的相对经济重要性,产奶性状、繁殖性状和体型性状的相对经济重要性分别为58%、12%和30%。将繁殖性状和体型性状做为育种目标性状,保证我区在奶牛遗传改良过程避免由于产奶性能的提升引起其它性能的下降,为我区“平衡育种”理念的发展奠定基础,也为后续综合选择指数的构建提供基础参数。（3）构建新疆地区荷斯坦牛综合选择指数为:CPIXJH=50×ENMY/997.46+4EBFP/0.20+3×EBPP/0.09-EBSCS/0.37-10×EBCI/22.47-2×ENAFC/2.26+8×EBFL/0.70+8×EBMS/0.27+14×EBType/0.43（4）新疆地区荷斯坦牛305 d产奶量、泌乳系统评分和体型总分的遗传趋势呈现明显上升趋势,乳脂率和乳蛋白率呈现相反趋势,乳脂率为下降趋势,乳蛋白率为上升趋势,体细胞评分则呈现缓慢上升趋势,产犊间隔、初产月龄和肢蹄评分则呈现明显下降趋势。不同性状的遗传趋势反映了我区荷斯坦奶牛多年的遗传改良效果,同时也为后续选种选配提供参考。（5）结合新疆地区荷斯坦牛综合选择指数（CPIXJH）公式计算了荷斯坦在群母牛CPIXJH值,在群母牛CPIXJH均值为15.71,选择排名前3000的母牛作为高产核心群。1、2、4、5、6、7号牧场分别有640、430、699、447、199、585头母牛被纳入3000头高产核心母牛群中。（6）基于基因组信息对357荷斯坦后备母牛进行遗传评估,计算出各产奶性状育种值,并结合GCPI2计算综合育种值,357头后备牛平均基因组综合育种值为1834.42,在排名前20的后备牛终有8头均为HOCHNM11112651号公牛的后代。综上所述,本研究以呼图壁种牛场为研究对象,通过常规和基因组遗传评估和综合选择指数的构建,计算出357头后备母牛基因组育种值,为新疆呼图壁种牛场构建3000头高产核心群,同时也为我区精准选配、育种规划的制订以及提高奶牛生产性能水平提供参考。
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