高校基建工程内部审计作为高校内部审计的重要内容之一,在规范管理,完善内控,节约投资资金,促进党风廉政建设等方面起着重要作用。为了增强人们对它的重视,了解当前此项管理工作中存在的突出问题,认识到实施全过程、多方面审计制度的紧迫性,深入研究此问题是历史赋予高校内审人员的使命。笔者从整理出的文献资料入手,探讨了有关理论与实践问题,具体从高校基建工程的特征及内容、全过程跟踪审计、基建部门领导经济责任审计、委托审计与监理等九个方面做了分类梳理,对现状有了比较全面的认识,并指出了现有研究的不足。本文通过网络调查、深度访谈及案例分析的方式对存在的问题进行了调查与分析,分析指出：工程内审目标定位不科学,缺乏风险意识和绩效审计理念,委托代理关系不明确,受托责任履行效果不佳；内审机构不独立,审计人员不足；审计内容不全面,重点太局限,审前准备不充分,审计方案不完善,审后跟踪不到位,审计技术与方法较落后,审计报告不够客观与实用。以上问题致使内审缺乏独立性与客观性,工作质量得不到保证,审计的作用不能有效发挥。针对存在的问题,笔者从高校、建筑方、监理方、政府等方面对工作环境进行了系统分析,提出了进一步规范管理的对策与建议。审计目的应定位于帮助学校实现价值的增加,高校应明确委托与受托责任；确保内审的独立性与客观性；实施制度导向的内部审计控制,全面落实工程项目的全过程跟踪审计等五项审计制度；在改善审计工作环境方面,高校应重新认识审计的重要性,政府应加大力度对几大行业和相关专业技术人员实施规范而严格的监管。本文从理论和实践出发,对所研究的问题做了比较系统的分析,在内审工作环境分析方面做了有益的尝试,突破了就审计问题论审计问题的局限性。笔者提出了高校应全面实施五项审计制度的对策,其中,对工程监理实施审计丰富了高校内部审计的内容,具有一定的贡献。本文选取了50所内审网页建设较好的高校作为研究样本,旨在分析管理问题。该调查的局限性为：样本选择具有时间上的随机性,有的高校其审计主页在笔者调查时处于改版期；样本选择具有主观局限性,不知名而内审网页建设较好的高校没被调查；为了样本代表省(区)的广泛性,舍弃了一些审计主页较好高校(广东、湖北等省高校),选择了一些审计主页次好的高校；一般情况下,审计主页建设得好其审计工作开展得也好,但也有例外。此外,笔者有限时间内的访谈还不够深入,对审计案例的选择和分析也存在不足。对于高校基建工程的绩效审计、风险审计的研究还需要继续。