乙肝病毒(HBV)感染是一个严重的临床问题，据世界卫生组织的资料表明，全世界约3.5亿到4亿人为HBV慢性感染。乙型肝炎病毒的突变会导致其免疫逃避、产生抗病毒治疗的耐药性以及其它临床表征，这些突变位点有的在HBV进化过程中受到正选择，所以发现HBV基因组上受到正选择的位点不仅对于研究其进化具有理论意义，而且对于免疫治疗和抗病毒治疗具有实际的提示意义。　　 世界三大核酸数据库(GenBank，EMBL和DDBJ)库中目前已经登录来自46个国家和地区的HBV全基因组的8种基因型1000多条序列。本研究分为两部分，第一部分工作将公共数据库中的所有HBV序列以基因型为分类标准分成组，并用Yang的基于密码子的最大似然率分析方法(codon-based maximumlikelihood analysis-ML)，对HBV各个基因序列进行氨基酸水平的正选择分析。检测出了preC/C、X和P基因上受到正选择的氨基酸位点，并对这些位点的生物学意义进行探讨，发现这些位点与HBV抗原表位和个别功能域具有密切联系，其中preC/C基因和X基因上发现的位点几乎全部位于其抗原表位上，P基因上发现的位点在间隔区(spacer)上和反转录酶(RT)区上相对集中。　　 第二部分对公共核酸数据HBV的现有全部基因组序列进行了统计分析并从基因型的地理分布及其临床特征等方面进行了评述，为进一步研究病毒与宿主的关系，以及HBV的人群分布和进化历史提供帮助。同时对所有登录的中国地区HBV全基因组序列及其课题组新近完成的序列进行了基因分型，并根据这些序列建立了中国地区B基因型和C基因型的参照序列。