自20世纪50年代在对无形资产计量时首次采用公允价值后，公允价值成为会计理论界和实务界研究的宠儿，无论是在国外还是在国内，学者们对公允价值计量和应用的研究一直从未间断。会计界对会计计量模式选择的总体趋势倾向于公允价值计量模式。公允价值计量模式下公司业绩与高管薪酬关系的研究，源于代理理论。合理的高管薪酬机制以剩余索取权为纽带，将管理人员的利益与企业的经营业绩挂钩，将经理人的收益与其经营能力和工作努力程度相连，能够有效地评价管理层的工作绩效和努力程度，激励和约束经理人的行为，降低公司的委托代理成本和企业的经营风险。出于有效控制股东与管理者之间代理成本的目的，诞生了与企业业绩相关的高管薪酬契约。公允价值变动损益计入企业的当期损益，会直接影响到企业的利润或者业绩，高管人员可以利用公允价值来改变公司业绩或者寻找薪酬契约机制的漏洞操纵利润，牟取利益。因此，考虑高管人员的薪酬与公司业绩的关系时不能忽视公允价值计量的影响。文章选择公允价值计量在应用过程中对高管薪酬的影响为切入点，从正反两面论述高管薪酬与公司业绩的相互联系，点明在金融危机和会计准则国际趋同的背景下热烈探讨高管薪酬与公司业绩关系的必要性和意义，综述了公允价值计量下公司业绩与高管薪酬的相关理论及研究动态，根据A股上市公司2010与2011年高级管理人员的相关薪酬数据和农业上市公司2006年至2010年的财务指标，分别描述了高管薪酬的现状和公司业绩的简况，选取高管薪酬水平均值排名靠后的农、林、牧、渔业上市公司的年报财务数据作为样本，采用结构方程模型验证了公司业绩与高管薪酬之间关系的存在性，在此基础上借鉴以往研究经验和二阶因子分析拟合的结论，选取不同的公司业绩衡量指标建立两个多元回归模型，分别对比研究在农业类上市公司中公司业绩与高管薪酬二者之间是否存在相关关系。实证研究结果显示，结构方程模型在验证高管薪酬与公司业绩之间的关系存在性和拟合公司业绩的衡量指标体系时是颇有成效的；通过回归模型分析，农业类上市公司高管薪酬与公司业绩之间存在显著的正相关关系。