本文从研究我国湖泊水库环境现状及其问题成因入手，介绍了湖库的水动力学特征及其数值模拟，对当前湖泊水动力数值模拟的主要研究成果进行了简要的说明。在对水环境数学模型基本理论和主要紊流模型加以阐述的基础上，对环境数学模型的发展历程以及目前应用较广的水质模型及软件包进行了介绍。同时，对MIKE3数学模型数学基础、计算方法做了较为详尽的介绍。 MIKE3软件具有较为强大的前后处理功能，数据录入、整理方便快捷；并可以和WORD、EXCEL等办公软件进行良好的配合，从而减轻了前期资料处理方面工作的负担。 论文将MIKE3数学模型应用于两个具体工程研究项目：(1) 湘潭电厂取排水口温度场模拟研究；(2) 万家寨水库温度场的数值模拟。 “湘潭电厂取排水口温度场模拟”显示了良好的水体三维流动结构，并与实测水温分布吻合良好。从计算结果可以看出，湘潭电厂的取排水口位置分布合理，能够满足经济和环保的要求。同时在进行对比计算的过程中还可以看出，河道上游的来流量与排水口的出流量之间的比例关系对温度扩散影响较大。 通过对“万家寨水库的三维流场与温度场的数值模拟”可以看出，万家寨水库属于典型的分层型水库，水库在不同的年份均长时间保持分层结构。库区的水温分层现象在枯水年比丰水年更加明显，在一年中的春夏两季比秋冬两季明显。水库水温的分层结构受来流量的影响较大。 上述两算例计算结果表明，三维流场、温度场预测可靠合理，精度较高。MIKE3软件对于此类问题具有较高的实用价值。