食品中单增李斯特菌分型技术的研究及其在溯源中的应用

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:xuhaibin_213
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本文首先应用微生物鉴定仪(Vitek-2 Compact)对实验室分离的104株单增李斯特菌和1株标准李斯特菌菌株共105株实验菌株进行了确认鉴定,结果与预期一致,均为单增李斯特菌。分型技术是根据菌株的生化特征或基因碱基组成的不同,而区分不同来源的菌株,从而实现对食品污染源或某次疾病暴发的追踪溯源。基于rep-PCR的自动化的DiversiLab分型系统是一种最近才发展起来的分型方法,具有快捷、方便和高效等优点。本文应用血清分型方法与DiversiLab分型技术,对105株供试单增李斯特菌进行分型分析。主要结果如下:血清分型分析结果表明,所有供试的105株菌被分为了 1/2a、1/2b、1/2c、3b、4b、1/2等6种血清型,全部为致病型血清型,主要血清型为1/2a、1/2b和1/2c共3种,占菌株总数的93.33%。应用DiversiLab分型系统对所有供试的105株单增李斯特菌进行分型,建立了单增李斯特菌的DiversiLab分型方法,其分型步骤包括DNA提取,rep-PCR扩增,灌胶,芯片电泳和图谱评估等;并且建立了 105株供试菌株基于DiversiLab系统软件平台的DiversiLab数据库。根据DiversiLab数据进行聚类分析:在相似系数低于70%时,所有105株供试菌株被分成了 2大类(Ⅰ和Ⅱ),有69株菌被聚类在平均相似系数在70%以上的Ⅱ类里,有36株菌被聚类在平均相似系数在80%以上的Ⅰ类里;当相似系数为95%时,所有供试菌株被分成了 18大类,各大类内的菌株之间都具有相关性;当相似系数为97%时,所有供试菌株被分为了 34组,每一组内的菌株之间都不可区分。聚类分析结果表明,来自同一食品生产企业且血清型相同的菌株一般都具有相关性或不可区分,这说明它们可能是来自同一污染源。同时,也有从不同地方或不同食品生产企业分离的某些菌株间具有高度的相似性,这可能是该基因型的菌株具有流行性。菌株的DiversiLab数据聚类分析结果与其血清型密切相关,血清型为1/2b、3b、4b、1/2的4种菌株都被聚类在Ⅰ大类里,血清型1/2a和1/2c的2种菌株都被聚类在Ⅱ大类里。DiversiLab分型的分辨率比血清分型要高,能将相同的血清型分为不同的类型。在相似系数为95%时,血清型为1/2a的菌株被分成了13个组(包括xviii,xvii,xvi,xv,xiv,xiii,xii,xi,x,ix,vii,vi,v),血清型为 1/2c 的菌株被分为了 3组(包括xvi,ix,viii),血清型为1/2b的菌株被分成了 4组(包括iv,iii,ii,i),血清型为4b的菌株被分为了 2组(包括iv,iii)。在Ⅱ大类里,有5株(L110、L037、L042、L038和L036)单增李斯特菌是进口来源的菌株,其血清型表现与国内来源的菌株不一致。最后对DiversiLab分型系统进行了一个展望性的应用,以HACCP体系为基础,建立起了烘烤肉制品、冷冻烤鳗、虾/仁(养殖)的加工工艺的溯源框架,为将来企业出现有单增李斯特菌污染后指明了基于DiversiLab分型的溯源方向。该成果的应用对企业经济利益、食品安全与人民身体健康的保障具有重要意义。
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