【摘 要】
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【目的】卵巢衰老会引起生殖和内分泌功能障碍,导致多器官功能紊乱,甚至造成子代健康状况下降。年龄是引起卵巢衰老的主要因素。但是,增龄性卵巢衰老过程中基因表达谱变化的研究甚少。在本文的研究中,我们利用了生物信息学技术来筛选、鉴定,并验证了增龄性卵巢衰老中的关键基因和潜在生物标记物,并揭示了可能的分子机制,为干预增龄性卵巢衰老提供潜在靶点。【方法】从GEO数据库中筛选增龄性卵巢衰老相关数据,确定并下载G
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【目的】卵巢衰老会引起生殖和内分泌功能障碍,导致多器官功能紊乱,甚至造成子代健康状况下降。年龄是引起卵巢衰老的主要因素。但是,增龄性卵巢衰老过程中基因表达谱变化的研究甚少。在本文的研究中,我们利用了生物信息学技术来筛选、鉴定,并验证了增龄性卵巢衰老中的关键基因和潜在生物标记物,并揭示了可能的分子机制,为干预增龄性卵巢衰老提供潜在靶点。【方法】从GEO数据库中筛选增龄性卵巢衰老相关数据,确定并下载GSE84078数据集,其包含10只正常C57BL/6小鼠卵巢样本的数据,包括5只年轻(5-6月龄,育龄期)和5只年老(21-22月龄,卵巢衰竭期)小鼠卵巢样本。比较年轻小鼠和年老小鼠的卵巢mRNA表达水平,筛选出差异表达基因(differentially expressed genes,DEG),进行功能富集分析,然后构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用qPCR分析和免疫组化染色进行验证,用CIBERSORT评估免疫细胞浸润,进行核心基因(Hubgene)与免疫细胞类型之间的相关性分析。【结果】首先,我们通过比较年老小鼠和年轻小鼠的卵巢表达数据,筛选了931个DEG,包括876个上调的基因和55个下调的基因。功能富集分析表明,DEG的生物学功能主要是免疫应答调节、细胞间粘附和吞噬途径。PPI网络分析和关键基因筛选,鉴定到DEG中最密切相关的Hub基因:Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g。使用qPCR分析验证,Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g与上述生信分析结果相符;使用免疫组化染色方法验证,Lcp2,H2-Ab1,Itgb2和Cd14与上述生信分析结果相符。应用CIBERSORT脚本评估增龄性卵巢衰老过程中的免疫细胞浸润及Hub基因与免疫细胞类型之间的相关性分析结果表明,浆细胞和初始CD4+T细胞可能参与增龄性卵巢衰老。Hub基因表达与记忆B细胞、浆细胞、M1巨噬细胞、Th17细胞和未成熟树突状细胞呈正相关。【结论】本研究揭示了Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g等Hub基因可能通过调节免疫过程参与了增龄性卵巢衰老过程。以上筛选出的DEG和通路将有望为研究人员揭示增龄性卵巢衰老的分子机制和潜在生物标志物提供理论支持,为增龄性卵巢衰老的治疗提供有效的分子靶点。
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