基于GEO数据库对增龄性卵巢衰老中关键基因与通路的筛选与初步验证

来源 :华中科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lianxingjiehaha
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
【目的】卵巢衰老会引起生殖和内分泌功能障碍,导致多器官功能紊乱,甚至造成子代健康状况下降。年龄是引起卵巢衰老的主要因素。但是,增龄性卵巢衰老过程中基因表达谱变化的研究甚少。在本文的研究中,我们利用了生物信息学技术来筛选、鉴定,并验证了增龄性卵巢衰老中的关键基因和潜在生物标记物,并揭示了可能的分子机制,为干预增龄性卵巢衰老提供潜在靶点。【方法】从GEO数据库中筛选增龄性卵巢衰老相关数据,确定并下载GSE84078数据集,其包含10只正常C57BL/6小鼠卵巢样本的数据,包括5只年轻(5-6月龄,育龄期)和5只年老(21-22月龄,卵巢衰竭期)小鼠卵巢样本。比较年轻小鼠和年老小鼠的卵巢mRNA表达水平,筛选出差异表达基因(differentially expressed genes,DEG),进行功能富集分析,然后构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用qPCR分析和免疫组化染色进行验证,用CIBERSORT评估免疫细胞浸润,进行核心基因(Hubgene)与免疫细胞类型之间的相关性分析。【结果】首先,我们通过比较年老小鼠和年轻小鼠的卵巢表达数据,筛选了931个DEG,包括876个上调的基因和55个下调的基因。功能富集分析表明,DEG的生物学功能主要是免疫应答调节、细胞间粘附和吞噬途径。PPI网络分析和关键基因筛选,鉴定到DEG中最密切相关的Hub基因:Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g。使用qPCR分析验证,Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g与上述生信分析结果相符;使用免疫组化染色方法验证,Lcp2,H2-Ab1,Itgb2和Cd14与上述生信分析结果相符。应用CIBERSORT脚本评估增龄性卵巢衰老过程中的免疫细胞浸润及Hub基因与免疫细胞类型之间的相关性分析结果表明,浆细胞和初始CD4+T细胞可能参与增龄性卵巢衰老。Hub基因表达与记忆B细胞、浆细胞、M1巨噬细胞、Th17细胞和未成熟树突状细胞呈正相关。【结论】本研究揭示了Tyrobp,Rac2,Cd14,Zap70,Lcp2,Itgb2,H2-Ab1和Fcer1g等Hub基因可能通过调节免疫过程参与了增龄性卵巢衰老过程。以上筛选出的DEG和通路将有望为研究人员揭示增龄性卵巢衰老的分子机制和潜在生物标志物提供理论支持,为增龄性卵巢衰老的治疗提供有效的分子靶点。
其他文献
学位
高速永磁电机在高基频运行和低载波比情况下,控制延迟会严重影响驱动系统稳定性和引起电流环控制失稳。介绍了控制延迟产生机理,对考虑控制延迟后的电流环模型进行重构,并系统分析低载波比下延迟引入的交叉耦合和时滞效应对电流环稳定性的影响,提出了通过计算得到电机在额定转速处稳定运行需补偿的延迟时间,对控制延迟角进行离线补偿的策略。基于一台1.5 kW、18 000 r/min实验样机,对永磁同步电机矢量控制系
期刊
作为国家形象的重要组成部分,国家领导人形象直接影响着国际政治和经济交往。尤其是在现代媒介技术飞速发展的背景下,国家领导人的形象及其权力愈加透明化,对内和对外的宣传界限并不明显,只能在大方向之下有所侧重。对于他国民众而言,主要依托所在国媒体的建构和传播了解他国国家领导人,进而对他国国家形象、社会文化产生深入认知。但受到国家利益、外交政策、媒体报道方针等诸多因素的影响,所认知的形象极易发生“变形”。普
学位
炼化企业供应链协同优化对实现智能炼厂至关重要,计划优化系统是供应链协同优化实现的核心系统。本文详细介绍了规划总院自主研发的新一代计划优化软件整体框架及主要功能,在该平台基础上结合炼化一体化企业流程数据、原油数据库及产品销售等边界条件进行了炼化一体化模型设计及建设,用于开展各类优化分析,并基于线性规划原理,通过边际效益分析及多方案对比分析,结合原油保本价法、缩减成本法及等量替代法等不同的原油选购方法
期刊
伴随数字时代的来临,新媒体技术的兴起给予了使用者内容生产的权力,打破了传统意义上媒介“自上而下”的传播路径,将话语权重新分配给了个人。其中,网络直播作为现代媒介技术发展的生力军,打破了电视端直播节目“一对多”的垄断壁垒,做到了“多对多”的实时反馈及互动。当互联网这一公共领域与家庭空间这一私人领域通过直播技术相遇,他们之间的连接者——“在家直播的人”便具有了研究价值。由于社会化分工的性别选择,主妇群
学位
刀具磨损状态监测在切削加工中十分重要,它直接影响着工件的尺寸精度与表面质量。通常采用光学显微镜对刀具磨损进行直接测量,这种办法需要拆卸刀具并且比较耗时。基于机器视觉的刀具磨损检测方法,可实现在机检测并提高检测效率。本文基于工件表面纹理特征对刀具磨损检测方法进行研究,通过实验采集工件表面图像数据并提取图像中的纹理特征,使用机器学习中的决策树模型完成对纹理特征数据集的分类,实现刀具磨损状态检测。本文的
学位
随着综合国力的稳步提升,我国正逐步走近世界舞台的中心,成为国际社会关注的焦点,这使得西方世界对中国产生了越来越谨慎而复杂的看法,“中国威胁论”等歪曲抹黑我国的论调屡屡不绝。话语即权力,我国在发展硬实力的同时,也极为重视软实力建设,强调把握国际话语权,展示良好的国家形象。在对外传播的过程中,我国政府越来越意识到新闻发言人的重要性,并且加大了对女性新闻发言人的任用与培养力度。新闻发言人在政府运行过程中
学位
目的:探讨支气管哮喘气道平滑肌雌激素受体α和β表达水平及其在气道平滑肌表型转化、增殖和迁移中的作用。方法:我们通过临床标本,动物实验,细胞实验三个维度对上述目的进行探讨。首先我们共纳入了10名在支气管镜下气道粘膜活检且在粘膜切片上有平滑肌层的哮喘患者和3名健康对照,并收集这些临床受试者的基本临床信息,具体包括受试者性别、年龄、BMI(Body mass index,体重指数)、肺功能。然后我们利用
学位
【目的】上皮性卵巢癌有发病率高、早期不易就诊诊断、复发及耐药发生率高等特点,现已成为女性肿瘤的第五大杀手。卵巢癌的一线治疗是初次减瘤术与铂类为基础的化疗结合。而目前批准用于卵巢癌的PARP抑制剂已有三种。他们可用作BRCA突变的复发性卵巢癌患者的后线治疗以及卵巢癌的维持治疗,其中尼拉帕利的维持治疗既可用于BRCA突变人群,又可应用于没有BRCA突变的患者。然而对于靶向药的耐药性和机制研究,目前讨论
学位
<正>以杭州公共体育基础设施为研究对象,分析其数量、种类、分级制度以及分布情况,并结合R语言找出其空间布局影响因素。从公共体育设施面积和总体服务水平两方面对杭州市各区的公共体育设施水平进行评价,推测各区域体育基础设施配置的合理性,进而根据体育设施发展现状提出针对性建议。健康水平是衡量当今世界经济社会发展和人民幸福程度的综合指标,体育是各国综合国力的体现。因此,
期刊