小麦三种土传病害巢式PCR和LAMP检测方法的建立

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小麦作为全球产量仅次于水稻和玉米的第三大粮食作物,在我国拥有广大的种植面积。河南省作为我国小麦的主产区,年产量位居全国第一。小麦土传病害是制约小麦生产的重要因素之一。近年来,小麦土传病害的发病率逐年上升,危害越来越重,严重威胁着小麦的生产安全。由于小麦土传病害早期发病症状较为相似,容易混淆,因此建立小麦土传病害的早期快速诊断方法迫在眉睫。本研究针对三种小麦土传病害:小麦纹枯病、小麦全蚀病和小麦根腐病,通过对3种病害病菌的ITS序列作为靶标序列,分别建立了3种土传病害的巢式PCR(Nested PCR)检测体系及LAMP(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测体系,为实现小麦3种土传病害的快速诊断提供了有力的技术保障。主要研究结果如下:1.成功构建了小麦3种土传病害的巢式PCR检测体系。该体系以3种待测病原菌的DNA为模板,以ITS区域为靶标序列,利用Primer Premier 5软件进行引物设计,以小麦赤霉病菌、小麦秆黑粉病菌、小麦叶绣病菌、小麦条绣病菌、齐整小核菌、立枯丝核菌、链格孢菌、固执腐霉、瓜果腐霉、大豆疫霉及烟草疫霉等作为对照菌株进行引物特异性检测,引物特异性良好,能够特异地检测出目的菌株。通过对小麦纹枯病菌、小麦全蚀病菌及小麦根腐病菌进行灵敏度检测,3种病原菌的检测极限分别为10-3ng·μL-1,10-4ng·μL-1,10-4ng·μL-1。将3种病害的病原菌接种小麦后,对其发病组织进行检测,结果显示该体系能够从小麦组织DNA中成功检测出目的病原菌,且最早检出时间均为病原菌接种后12小时。2.成功构建了小麦3种土传病害的LAMP检测体系。根据3种待测病原菌的r DNA-ITS基因序列独立设计并合成3对引物,以小麦赤霉病菌、小麦秆黑粉病菌、小麦叶绣病菌、小麦条绣病菌、小麦白粉病菌、齐整小核菌、立枯丝核菌、链格孢菌、固执腐霉、瓜果腐霉、大豆疫霉及烟草疫霉等作为对照菌株进行引物特异性检测,对照菌株均呈阴性反应,引物特异性良好。对小麦纹枯病菌、小麦全蚀病菌及小麦根腐病菌进行灵敏度检测,3种病原菌的检测极限分别为1pg、10 pg和1 pg。将3种病害的病原菌接种小麦后,对其发病组织进行检测,结果显示该体系在病原菌接种后12小时能够从小麦组织DNA中成功检测出目的病原菌。总之,本试验基于小麦3种土传病害所建立的巢式PCR及LAMP两种分子诊断技术,均能够有效用于小麦3种土传病害的快速诊断,两种检测体系具有特异性强,灵敏度高,适用性强的优点,能实现小麦3种土传病害的快速诊断。
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