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茄子(SolanummelongenaL.2n=24)是世界上重要的蔬菜作物,我国是全球茄子栽培面积最大、产量最多的国家,且近年来栽培面积逐年增长,在蔬菜生产中占有越来越重要的位置。为了提高茄子育种水平,育种工作者都努力从分子水平上掌握资源的遗传信息。
反转录转座子以高拷贝形式广泛存在于植物基因组中,异质性高,在种内和种间表现出较高的序列差异性和丰富的插入多态性。由于这些特点,使其作为一种分子标记得以应用,并越来越受到重视,IRAP和REMAP就是两种基于反转录转座子的分子标记技术。
本研究以35份茄子为试材,应用几种Copia类型的反转录转座子进行引物设计,首次建立了茄子IRAP和REMAP分子标记技术体系,两种方法都得到了多态性丰富的指纹图谱,并对供试材料进行了基于IRAP的遗传多样性分析。获得主要结论如下:
1、根据烟草的反转录转座子Tnt1和大麦反转录转座子Bare-1的LTR保守区域设计引物,开发出了茄子基于反转录转座子的分子标记IRAP和REMAP,并以引物P1-1进行了反应体系的优化。
2、以优化后的反应体系对供试材料进行扩增,得到了基于IRAP和REMAP的独特着纹图谱,可以作为区分不同品种的依据。
3、对35份栽培品种进行了基于IRAP的遗传多样性分析,根据Tnt1,Ttol,Tnd-1和Bare-1设计的6个引物共扩增出195条带,多态性带179条,多态性比率平均为91.8%,Nei’s遗传相似系数为基础利用NTSYS程序从分子水平上将供试品种大体分为4类,类群的划分与单一果型或果皮颜色等植物学性状没有直接关系,与表型性状的聚类结果不一致。