嗜热真菌多糖单加氧酶氧化特性与生物学功能研究

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:lyx_suda
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
能源是一个国家正常运转的内在动力,直接关系到社会的稳定和发展,影响着国家的经济命脉和安全,同时也影响着生态环境的保护、开发与利用。植物源生物质具有分布广、可再生、储量大的特点,被视为是一种可以替代化石能源的新型碳能源和可再生资源。目前,人们对植物生物质资源的利用已经有了丰硕的成果,但是由于植物源生物质种类的多样性以及结构的精密性和复杂性,导致了植物生物质的利用还存在许多障碍。近年来研究人员在生物质降解方面发现了一类新的纤维素降解酶系——依赖铜离子的多糖单加氧酶(Polysaccharide monooxygenases,PMOs),可以氧化裂解包括纤维素在内的高分子物质,为植物生物质的高效利用提供了新的思路。PMO是近年来研究较为广泛的一类酶,是首次发现的可以依赖铜离子进行催化的氧化酶。该酶广泛分布于具有纤维素降解能力的真菌、细菌以及病毒中。该酶一经发现,由于其具有较低的纤维素降解活性,在很长时间内都将其归类为糖苷水解酶61家族(GH61)和碳水化合物结合模块33家族(CBM33)家族。2013年对这两个家族的酶进行了新的分类,将其划分至辅助活性酶类,分别归类为AA9家族和AA10家族。目前共发现8个家族的PMO。PMO是一类在还原剂存在的条件下,通过在不同碳位加氧引起羟基化作用,造成糖苷键断裂的铜离子依赖酶。由于PMO这种特殊的断键机制,降低了从高度结晶纤维素上分离纤维素链的难度,从而提高了纤维素酶的降解效率。PMO同样在植物病理学研究中起着至关重要的作用,作为一种细胞壁降解酶,其可以在植物病原微生物侵染植物时氧化裂解细胞壁,消除植物防卫屏障,加速病原微生物的入侵,也可以作为效应子参与病原微生物的致病过程或引起寄主植物的免疫防卫反应,此外,在不同物种之间的共生过程中,PMO也可以参与物种间的营养转运和信息传递等过程。为了探究PMO的酶解特性及其在动物消化道内的生物学功能,本研究以嗜热革节孢AA9家族的PMO酶HiPMO1为研究对象,深入研究了该酶的活性、氧化方式、产物组成成分以及和纤维素酶的协同作用;明确了马消化道中存在纤维素的氧化降解;探索了嗜热真菌AA9家族PMO在马消化道中的生物学功能,对马消化道中嗜热真菌的定殖、AA9家族PMO蛋白的表达以及产物的组成做了分析和鉴定。结果如下:利用真核表达技术获得HiPMO1酶,将HiPMO1酶和不溶性底物磷酸膨胀纤维素(PASC)在p H 5.0、50℃及还原剂存在条件下反应48 h。薄层层析(TLC)检测结果显示HiPMO1酶对不溶性底物PASC具有活性,且随着反应时间的不断推移,产物量也在不断增加,产物主要由纤维二糖至纤维五糖构成。对产物进行甲基化处理,基质辅助激光解析电离飞行质谱(MALDI-TOF-MS)分析甲基化处理后的样品显示,反应产物中存在以C1氧化型和C4氧化型为主的纤维寡糖。为了进一步分析酶解产物的组成成分,首先将酶解产物经三氟乙酸(TFA)水解,利用高效液相色谱-示差折光检测法(HPLC-RID)分析,证明了反应产物中存在C1氧化产物;再利用硼氢化钠对酶解产物进行还原反应,再进行TFA水解,利用HPLC-RID分析也证明了产物中存在C4氧化产物。此外,我们还初步分析了HiPMO1酶和纤维素酶之间的协同作用。利用HiPMO1酶预处理PASC,再用三种纤维素酶(EGII、CBHI、BGLI)分别对底物进行酶解,利用DNS法检测反应结束后产生的还原糖产量,结果显示还原糖产量分别增加了1.35倍、1.49倍和1.33倍;而以CMC-Na为底物时,还原糖产量分别增加了0.24倍、0.36倍和0.55倍。综上所述,HiPMO1酶在氧化裂解纤维素时存在C1和C4两种氧化方式,并且底物和纤维素酶种类的不同也会影响HiPMO1酶的协同作用。为了探究嗜热真菌AA9家族PMO在动物消化道内的生物学功能。首先对马粪和马胃食糜中不溶性纤维素进行了分离提取,用内切-1,4-β-D-纤维素酶对不溶性纤维素进行酶解反应,对酶解产物分别用MALDI-TOF-MS、LC-MS(液相色谱质谱联用)、HPAEC-PAD(高效液相离子色谱安培检测器)和HPLC-RID进行分析。结果表明马粪和马胃不溶性纤维素中都存在C1氧化型纤维素。利用乙醇对马胃食糜中可溶性纤维寡糖进行分离提取,利用MALDI-TOF-MS和HPLC-RID对提取物进行分析,结果显示可溶性纤维寡糖中存在C1和C4氧化型寡糖。以上结果都说明马的消化道中存在以C1和C4氧化型产物为主的纤维素氧化裂解现象。为明确马消化道中嗜热真菌的种类,我们成功从马胃食糜中分离了三种嗜热真菌并鉴定其种类。内部转录间隔区(ITS)测序结果显示,三种嗜热真菌分别是嗜热革节孢(Scytalidium thermophilum)、嗜热毛壳菌(Chaetomium thermophilum)和嗜热子囊菌(Thermoascus aurantiacus)。为了进一步验证三种嗜热真菌在马体温条件下的生长状况及其PMO基因的表达特征,将三种嗜热真菌转接至37℃纤维素培养基上,观察发现三种嗜热真菌均能正常生长,并且其AA9家族基因Hipmo1、Ctpmo1和Ta AA9A在此条件下均能正常表达。为了明确三种嗜热真菌AA9家族PMO基因在马胃中的表达特征,我们提取了马胃和马肠食糜的总RNA,利用PCR方法验证了两个AA9家族的PMO基因Ctpmo1、Ta AA9A可以在马胃和马肠中正常表达。结果证明三种嗜热真菌可以在马的消化道中定殖生长,并且其AA9家族的PMO基因可以正常表达。为了进一步明确马胃中PMO的种类及酶解特性,对马胃中的AA9家族PMO蛋白进行了提取,用DEAE-Sepharose阴离子交换层析法对蛋白进行分离纯化。利用LC-MS/MS(液相色谱串联质谱)对分离纯化的蛋白进行鉴定,结果显示存在6个嗜热真菌AA9家族PMO蛋白,其中3个来自太瑞斯梭孢壳霉(Thielavia terrestris),而另外3个分别来自嗜热革节孢(S.thermophilum)、嗜热毛壳菌(C.thermophilum)和嗜热子囊菌(T.aurantiacus)。此外,在37℃下分别用HiPMO1、Ct PMO1和Ta AA9A处理PASC,利用MALDI-TOF-MS和HPLC-RID对酶解产物进行分析,结果显示三种酶均可以产生C1氧化产物。以上结果直接证明马消化道中存在嗜热真菌表达的AA9家族PMO酶,并且可以在马体温条件下氧化裂解纤维素。此外,我们还发现白蚁粪便不溶性纤维素中也存在C1和C4氧化纤维素,证明了白蚁的消化道中也存在纤维素的氧化裂解现象。综上所述,本研究首先明确了HiPMO1酶在氧化裂解纤维素时存在C1和C4两种氧化方式,验证了HiPMO1酶可以和纤维素酶在降解纤维素时产生协同作用;其次证明了马消化道中存在以C1和C4两种氧化方式为主的纤维素氧化裂解反应;最后明确了马消化道中存在嗜热真菌表达的AA9家族PMO蛋白,而且其可以在马体温条件下氧化裂解纤维素。本研究拓展了AA9家族PMO新的生物学功能,也阐明了动物消化道内嗜热真菌的生物学意义。
其他文献
随着现代社会的不断发展,保险作为一种规避风险的重要投资手段,越来越受到投资者们的欢迎。面对市场上众多的保险公司和保险产品,如何在其中选择合适的产品进行投资组合,成为了很多投资者关注的热点问题。然而,由于保险的收益在不同情境下的差异可能很大,保险投资组合优化问题一般伴随着很强的不确定性。分布估计算法是一种基于概率分布的随机优化算法,由于其自身固有的随机性与问题不确定性之间的一致性,具有很强的处理不确
学位
作为甜菜制糖工业的副产物,甜菜粕是生产甜菜果胶(SBP)的理想原料。通常,果胶具有良好的凝胶性,在食品工业中应用广泛。然而,SBP的物理凝胶性质却不理想,受限于其自身的高乙酰基含量、高中性糖侧链含量以及相对较低的分子量。为了克服这些来自于SBP的凝胶限制条件,改变SBP凝胶性不强的局面,本文围绕SBP构建了系列水凝胶体系,并对其凝胶性质和凝胶机理进行了系统研究,旨在为SBP在凝胶领域的应用提供理论
学位
随着信息时代的革新以及人工智能的发展,更复杂和更友好的人机交互需求应运而生。作为一种跨语言的传递方式,人脸表情是实现机器理解人类情感的重要数据基础。人脸表情识别可以广泛应用在公共安全、医疗诊断、商业营销和虚拟现实等众多场景。近年来,深度学习方法由于强大的特征学习能力,依托高性能的计算资源显著提升了表情识别的准确率。然而,面对现实世界中爆发式增长的数据,个体差异、复杂场景和不确定性等普遍存在的问题严
学位
随着合成技术的不断发展,主链上含有金属原子的高分子聚合物材料的研究取得了令人瞩目的进展。与传统的有机高分子材料相比,金属聚合物在氧化还原、磁性、光学、催化等方面表现出明显的差异,在超分子科学、纳米材料等领域具有广阔的应用前景。聚二茂铁硅烷(polyferrocenylsilanes,PFSs)是其中一类最具代表性的金属聚合物。PFS主链由二茂铁和有机硅单元交替组成,链段间复杂的相互作用和独特的分子
学位
近年来,可穿戴柔性应变传感器在人类活动监测、生物医学、人工智能等方面展现出了巨大的应用前景,成为当前电子材料领域研究的热点之一。特别地,柔性电阻式应变传感器(FRSS)能将外部机械刺激转化为可视化的电阻变化信号,且具有灵敏度高、信号响应快、制造成本较低、稳定性好等优点,被认为是下一代物理传感器的优选者。然而大多数已报道的传感器存在制备成本高、工艺流程繁琐、传感性能有待提升等问题,难以实现大规模的生
学位
简单的链状原料可通过烯炔和二炔环异构化反应快速构建环状甚至是并环及多并环结构,而且这两类反应转化模式多样,原子经济性高,因此在过去的几十年得到了飞速的发展。从催化剂的角度来看,π酸性较强的金和铂络合物是催化这两类反应最为有效的催化剂,尤其是一价金,但一价金直线型配位的模式给实现环异构化反应的不对称带来了不小的挑战。从反应中间体来看,许多烯炔和二炔环异构化过程都需要经历金属卡宾中间体。双核铑卡宾是历
学位
当今世界,随着全球化进程的不断深化和现代信息技术的迅猛发展,各国之间的联系空前紧密。在此背景下,彼此交往时的“身份”-“国家形象”逐渐成为国际竞争的战略重点之一。国家形象问题的实质,是国家之间的相互认同。然而,在现今的世界传播格局中,中国之国家形象却面临着被西方世界“他者化”的现实困境。于是,“中国形象”建构与国际传播能力建设上升为国家战略并成为学界的热门话题。习近平曾多次强调指出,体育是人类进步
学位
目前,非线性科学的研究几乎涉及到了自然科学和社会科学的各个领域。特别是复杂系统,其中的非线性作用使得系统呈现出多种运动模式。混沌就是非线性系统的典型行为。无论是在物理学、数学、地球科学还是生命科学等众多科学领域中,混沌现象都得到了广泛研究。关于混沌的预测及其应用研究,已成为非线性科学研究中最重要的前沿课题之一。本文主要是利用机器学习的方法,探究对于混沌系统相关预测的问题。机器学习方法已被证明可以有
学位
“碳达峰、碳中和”战略的实施,使农机在跨区作业中存在的作业效率不均衡、实时存放难,信息传递不对称等问题变得更加紧迫,农机调度的智能化、绿色化已经成为农业信息化理论发展的前沿问题。为实现农机调度的节能减排,使农机更好的服务于农业生产,选择农机绿色调度系统为研究对象;基于时间驱动作业成本法,系统设计了农机作业监测系统的成本监测模块;基于逼近理想解与多目标规划模型,解决了农机库棚位置选择问题;并运用E-
学位
单细胞转录组测序技术是近年来应用最为广泛的新兴生物技术之一。单细胞转录组测序技术克服了传统的大量细胞转录组测序技术中基因表达平均化的缺点,在单个细胞层面上描绘转录组表达情况。高通量单细胞转录组测序技术的出现使得科研人员能够在单细胞层面上精细描绘各类复杂器官、组织和生物学过程中转录组情况,有力地推动了针对复杂生物学过程的科研研究。高通量单细胞测序技术的改进给各类生物学问题的研究提供了更好的工具。本论
学位