明朝对养马犹为重视，建立了众多马政机构，开创性的实行了种马与备用马制度。明朝的马政统于兵部，由太仆寺与苑马寺管理。太祖问鼎金陵之时养马就扩大至民间。到了永乐年间，为增加国家防卫军事力量的需要，成祖高度重视养马业的发展情况，养马分为军养和民养。军养是由在职的士兵或军户们完成的，民养的种类有京府寄牧（又称备用马制度）与民间孳牧（又称种马制度）。在民间朝廷分配马匹孳牧的方式有大致三种，分别是按户孳牧、按丁孳牧、按亩孳牧。三种标准按照不同地区，不同年代的状况来实行。民间领养的马匹的范围在北直隶、河南、山东、以及江南。永乐年间，通过官府百姓的诸多努力，使马匹数量大增，为军马的供应提供了充足的保障，但是明朝的马政也带来了如官员的腐败和百姓养马的负担沉重等诸多问题，马户们承担编审轮养之苦、杂役勒索之苦、赔买岁例之苦、点视印烙之苦、起解交兑之苦，明代马户承担着重役，养马与种地的辛苦不仅拖累马户们的身体，官员的征敛也折磨着马户们的精神，促使马户消极养马，甚至民变，后期的折银也影响了国防的军马供应，这些问题甚至影响到了明王朝的国家统治，这也是明朝马政的缺陷。