中国人原发性胃癌的比较基因组杂交研究

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目的:胃癌是我国常见的恶性肿瘤。目前认为,绝大多数胃癌是从正常上皮细胞发展至胃癌的演变过程产生,其原因包括环境和基因缺陷两方面等诸多因素。基因不稳在胃癌的发生中起着重要作用。它包括核基因组不稳(nMSI)和线粒体基因组不稳(mtMSI)。核基因组不稳又包括两种不同的形式,即染色体不稳(Chromosomal instability, CIN)和微卫星不稳(Microsatellite instability, MSI)。大多数的胃癌中存在着染色体的不稳定性。表现为遗传物质的增多(Gain)和丢失(Loss)。这种CIN的特点为我们进一步研究胃癌发生发展的机制提供了研究方向。本课题旨在通过比较基因组杂交(Comparative genomic hybridization, CGH)技术发现中国人原发性胃癌反复的染色体改变,以寻找与中国人胃癌发生发展相关的基因。方法:(1)基因组DNA的提取:原发性胃癌20例标本经蛋白酶K/SDS消化,酚/氯仿/无水乙醇提取基因组DNA。(2)缺口平移标记法标记探针:其中待检肿瘤DNA用绿色荧光标记,正常参照DNA用红色荧光标记。(3)原位杂交和染色:将上述两个探针等量混合并杂交到正常分裂期的染色体上并用DAIP进行染色体显带对照染色。(4)图象检测和分析:采用配备有CCD(Cooled-charged device)数码相机和分别通过3种荧光滤光片并连接有一个图像处理系统的荧光显微镜分析杂交结果。首先在荧光显微镜下选取待分析的染色体分裂相,每例标本至少测4~6组分裂中期染色体,以其平均比值,绘制出表意图形(比率曲线)。此曲线以1.0表示平衡状态,>1.2被认为有显著的DNA拷贝数增加;>1.4表示染色体区域有高拷贝数的扩增;<0.8则表示有明显减少,染色体区带处的比率异常表示该部位有扩增或丢失。结果:发现一些非随机性的染色体改变,包括20q(8例,40%)、5p(7例,35%)、1q(6例,30%)、8q( 6例,30%)DNA拷贝数的增多,其中20q的高拷贝数扩增二例;19p(11例,55%)和19q
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