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目的:1.描述三峡地区菌痢的流行特征和变化趋势,比较三峡库区县与非库区县菌痢发病特征的差异。2.探讨三峡地区菌痢的时空分布模式和发病热点区域,分析菌痢暴发与时空聚集区的关系。方法:收集中国疾病预防控制信息系统的传染病报告信息管理系统中2005年1月1日—2016年12月31日三峡地区菌痢报告发病数和报告发病率数据;从突发公共卫生事件报告管理系统中搜集同期的菌痢暴发疫情信息;收集《重庆统计年鉴》和《湖北统计年鉴》中的人口数据以及2010年人口普查资料,开展以下研究:1.将三峡地区2005-2016年菌痢发病水平与全国比较,并描述病例的时间、空间和地区分布特征;利用年报告发病率、月发病数来描述菌痢发病的长期趋势和季节性,提取病例的年龄、性别和职业信息并描述病例的人群分布特征;借助ArcGIS制作专题地图来直观展示各县(区)的发病水平和地区分布特征。2.利用ArcGIS将空间数据与病例数据建立空间关联,从而建立菌痢病例GIS数据库;采用全局、局部空间自相关(GeoDa软件)来探索三峡地区菌痢病例的空间聚集性;借助时空扫描统计量法,利用SaTScan软件研究菌痢的时空分布特征、判定发病的时空聚集区,结合三峡地区菌痢疫情暴发事件信息来解读菌痢高发聚集区,分析暴发疫情与时空聚集区间的关系。3.根据病例信息中的病人所属县区和“现住地址国标”,将病例划分为三峡库区县病例与非库区县病例,分析并比较三峡库区县与非库区县菌痢流行特征的异同。结果:1.2005-2016年三峡地区本地累计报告菌痢126 138例,报告发病率在20.84/10万～39.36/10万之间,年均发病率(28.93/10万)是全国(19.38/10万)的1.49倍;菌痢整体呈波动下降趋势,全国发病率年均下降速度(11.68%)较三峡地区(4.71%)快2.48 倍。2.菌痢全年各月均有发病,呈季节性分布,发病高峰集中在每年5-10月,8月达峰值;病例性别比为1.18:1,5岁以下儿童病例数最多(占45.53%),年龄别发病率最高(241.95/10万),70岁及以上的老年人发病率有逐渐增高趋势,其他年龄组均在较低水平波动;病例中散居儿童占比最高(占41.96%),其次为农民(占14.02%)和学生(占10.99%)。61个县(区)年均发病率差异较大,具有明显空间异质性,重庆市北部的城口县和主城区中的渝中区、大渡口区、江北区、沙坪坝区、九龙坡区、南岸区、渝北区以及宜昌市主城区(西陵区和伍家岗区)为菌痢高发县(区),年均发病率介于60.20/10万～114.81/10万之间。3.三峡库区县菌痢整体发病水平高于非库区县,12年间库区县累计报告菌痢84 661例,死亡12例,非库区县累计报告41 477例,死亡9例;库区县年均发病率(36.63/10万)是非库区县(20.20/10万)的1.81倍,非库区县发病率年均下降速度(6.48%)较库区县(4.07%)快1.59倍,但病死率(0.022%)是库区县(0.014%)的1.57倍。剔除重庆主城区后,库区县其他地区的发病率下降到总发病率的一半左右;非库区县在剔除宜昌主城区后,其他地区的发病率仅有小幅度下降。控制混杂因素(主城区)的影响后,其他地区发病率库区县等同或略低于非库区县。4.全局空间自相关表明,三峡地区菌痢发病在县(区)水平上呈空间正相关性,病例分布并非随机,呈显著地空间聚集性分布;局部空间自相关显示,热点县(区)范围变化不大,集中分布在重庆市主城区,主要为渝中区、江北区、沙坪坝区、九龙坡区、南岸区、北碚区、渝北区和巴南区。“冷点”地区多集中在三峡地区东北部,主要为奉节县、巫山县、兴山县、秭归县、巴东县、建始县和当阳市。5.时空扫描结果显示,2005—2016年三峡地区菌痢发病存在时间聚集性,主要集中在每年5—10月;菌痢病例在县(区)尺度上存在明显聚集性,探测出12个一类聚集区,35个二类聚集区以及9个无统计学意义的聚集区,集中发生在高发县(区),位置相对稳定,一类聚集区均位于重庆主城区及其周边县(区),二类聚集区由大范围集中变为散在分布。6.三峡地区2005-2016年累计报告39起菌痢暴发疫情,其中19起暴发发生在时空扫描的11个时空聚集区中,4个聚集区与暴发疫情信息一致,暴发对县(区)月发病的贡献率均值达84.90%,此4个时空聚集区是暴发事件导致产生的;另外4个聚集区与暴发信息部分吻合,其暴发对县(区)月发病的贡献率均值为55.54%;其他县(区)的疫情暴发贡献率相对较低,为35%～70%不等,差异主要源于自然状态下(消除暴发影响后)的发病率水平,自然状态下发病率水平高时,暴发贡献率低。结论:2005-2016年三峡地区菌痢年发病率明显高于全国平均水平,且下降趋势缓慢。病例以5岁以下儿童为主,散居儿童居多;发病具有明显季节性;重庆主城区发病率明显高于其他县区,还有个别县区发病率较高或多次发生暴发疫情。库区县与非库区县菌痢流行特征存在不同程度差异,剔除主城区造成的混杂后,库区县其他地区发病率等同或略低于非库区县,三峡水库的蓄水活动对菌痢发病水平的影响不显著。三峡地区菌痢发病在时间和空间上存在明显聚集性。高发时间段主要为每年5-10月,高发聚集区域主要集中在重庆主城九区,每年略有不同,重庆主城区内菌痢病例聚集风险高。一半的菌痢暴发事件发生在时空聚集区内,部分时空聚集区是暴发疫情导致,部分时空聚集区内容易发生暴发疫情,提示暴发疫情被动监测和时空扫描不可相互替代。