自然保护区是生物多样性保护的重要屏障,其在促进生物多样性保护、防止生物灭绝和栖息地丧失方面发挥着重要作用,生物多样性保护区的保护有效性评估及优化一直是生物多样性保护中的一个重要内容,但在保护区有效性评估以及优先保护区划定的方法上还不完善。目的:本研究以热带东非保护区为例,拟综合性的对保护区进行定量分析,构建保护区保护有效性评价模型,对保护区域规划提供指导意见,提高保护区应对干扰时的保护有效性,加强对未受到保护的物种或生态区的关注,进而促进生物多样性的有效保护。方法:本研究通过综合保护区的管理有效性、受威胁物种脆弱性以及应对全球变化的风险三个层面进行量化分析保护区的保护有效性,并通过定量分析和空间重叠的方法分别确定优先保护区域。其中,保护区的管理有效性评估包括保护区管理部门、保护目标和保护区IUCN管理等级三类;受威胁物种脆弱性评估包括受威胁植物和受威胁动物两类;应对全球变化的风险评估包括气候变化和人类干扰两类。结果:热带东非陆地保护区共有1709个,占土地面积的28.86%,但保护区存在空间重叠的情况;保护区管理有效性高的区域主要集中在热带东非的南部、西南部及中部;受威胁物种中有12.80%两栖动物、27.85%的爬行动物、36.35%的鸟类、36.23%的哺乳动物、35.23%的木本植物和35.15%的草本植物等的适宜分布区域并不在保护区内;在应对全球变化的风险分析中,热带东非约有17.12%区域受到降水减少、39.91%的区域受到强烈温度变化以及超过一半以上的区域会受到人为干扰等的影响;通过定量分析和空间叠加的方法确定的I级和Ⅱ级优先保护区域能够起到互补作用,这些优先保护区主要分布在热带东非的中北部、西部、西南部及东部沿海区域。结论:本研究对热带东非自然保护区的有效性评估主要是通过综合保护区管理有效性、受威胁物种脆弱性及应对全球变化风险三类指标体系,指出了当前热带东非保护区的保护空缺,提出了对评估保护区的保护有效性以及确定优先保护区的方法。本研究不仅促进了对热带东非保护区的有效性的提升以及优先保护策略提供了依据,更为全球生物多样性保护提供了可参考的借鉴价值。