目的:摸索适合白术基因组DNA提取方法，筛选白术ISSR引物，建立ISSR-PCR反应体系，检测白术ISSR分子标记，分析不同产地白术的遗传关系与白术多糖含量指标的变化情况，从而为白术的遗传育种，品种改良提供科学参考。　　方法：采用改良CTAB法和常规SDS法两种方法对比提取白术基因组DNA，运用单因素影响试验建立ISSR-PCR反映体系，通过NTSYS-pc version-2.11f计算机软件构建聚类树状图，结合紫外分光法检测白术多糖含量，对8个产地的白术（陕西延安，西安，四川，安徽，浙江，湖南怀化，贵阳，贵州铜仁）遗传关系和质量进行分析研究。　　结果:1.本实验通过不同水浴时间,不同的CTAB与SDS浓度，不同的离心转速对基因组 DNA提取进行了分析，从而获得了最适合白术的ISSR-PCR反应体系为改良CTAB法提取基因组DNA。其OD值在1.8～1.9范围内，表明其为高纯度的DNA。　　2.通过紫外分光光度法，检测多糖的吸收峰为490nm，建立标准曲线.测定样品吸光度，计算白术多糖含量分布在6.37％～32.6%之间，显示出8个产地白术之间的多糖含量差异较大。　　3.采用优化的白术ISSR-PCR的最佳反应体系从菊科中的众多引物中筛选出3条用于指纹图谱构建的引物：ISSR-18、ISSR-24、ISSR-36。计算每个引物的条带数，从而获得白术居群的相似系数。用 NTSYS-pc version-2.11f软件计算任意样品间的遗传相似度、遗传距离，构建聚类图。聚为2类：陕西延安，西安，四川，安徽，浙江聚为一类；湖南怀化，贵阳，贵州桐仁聚为一类。　　结论：在白术的生长繁殖过程中、由于环境、气候等地理因素的不同，来自不同产地的白术基因组DNA之间有差异，遗传相似度、遗传距离、亲缘关系不同，其白术多糖成分含量也随之有所变化，遗传关系相近,则它们多糖含量也很接近。