蓝光诱导海带幼孢子体转录谱变化的研究

被引量 : 3次 | 上传用户:hdyear
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
植物生长发育受光的调控。海洋环境中,许多不等鞭毛藻类利用蓝光调节自身生长发育,其对蓝光的应答具有独特的响应机制。Aureochrome(AUREO)是不等鞭毛藻类特有的蓝光受体之一,开展蓝光诱导海带响应基因的筛选和应答通路的解析不仅具有理论意义,也为海带生长发育的应用提供了重要参数。本文以黑暗和蓝光处理的海带幼孢子体为实验材料,结合高通量测序构建转录组文库,分析蓝光诱导的海带幼孢子体转录谱基因表达变化。通过对构建的海带幼孢子体cDNA文库进行RNA-Seq测序共获得非冗余unigenes70497条,平均长度538bp,通过同源比对获得25924条unigenes(36.6%)注释信息。在表达水平标准化基础上进行差异表达分析,发现在黑暗和蓝光条件下有11660条unigenes(16.5%)差异表达,包括7808条上调unigenes和3852条下调unigenes,推断蓝光诱导后海带幼孢子体转录组基因表达发生了较大变化。差异表达unigenes主要参与了海带的基础代谢、转录调控、蛋白质合成、酶活性调节等。通过筛选获得43条蓝光受体同源unigenes,其中28条受蓝光诱导后表达量显著上调;获得34条海带特异性蓝光响应unigenes,KEGG pathway分析其主要与生物节律、黄酮合成、光复活和光形态建成相关。在转录组数据基础上,采用同源克隆配合RACE-PCR方法获得海带AUREO蓝光受体(SjAUREO)基因全序列,基因全长1013bp,5’非翻译区为23bp,3’非翻译区为378bp,开放阅读框为612bp,编码203个氨基酸的蛋白。SjAUREO蛋白序列有一个N端亮氨酸拉链结构域(bZIP domain)和一个C端对光、氧气、压力敏感的结构域(LOV domain),与已报道的其它11条AUREO同源序列相似度为40%~92%。同源比对表明SjAUREO与褐藻水云(Ectocarpus siliculosus)的AUREO4亲缘关系最近。通过对不同生长时期海带幼孢子体qPCR检测,发现SjAUREO在一个月海带幼孢子体中表达量最大,据此推测SjAUREO可能参与了海带幼孢子体早期光形态建成。构建原核表达体系E. coli Transetta(DE3)/pEASY-E2(+)对SjAUREO进行体外表达分析,利用Ni柱亲和层析方法获得重组蛋白。对纯化后复性的重组蛋白进行光吸收检测,发现其在蓝光诱导30min后在400nm和460nm处有吸收峰。
其他文献
数学中蕴含着众多吸引人的规律,并且散发着无穷的魅力,但是如果让学生单纯地从课本中学习,是没有办法完全感受到的。所以,要培养学生的创新意识,就要在课本教材的基础上开展
摘要:公有云计算是一种第三方服务模型,云服务提供商(Cloud Service Provider, CSP)和云计算服务客户是该服务模型的两个关键实体,其中CSP拥有云计算服务平台的资产所有权和资
通过对一些典型例题的分析阐述了新课改后高考有机化学试题的变化:基础知识突出主干知识的综合性;注重基础与能力的结合考查;有机实验的考查开始得到重视。根据这些特点提出
2008年5月至10月采用目测法与网捕法调查湖北省武汉市水生蔬菜地昆虫群落结构,共采集到11目、48科、104种,共计9169头昆虫,其中,莲缢管蚜Rhopalosiphum nymphacae(L.)、茭白
对于涉及较多反应物和多步反应的问题,提出可用"一锅法"思想解题。以多种反应物参与的反应体系和有多种生成物的反应体系为例,通过7个例题的解析,说明用该思想方法进行化学计
<正> 1964年我下乡搞农药使用技术时,曾看到不少病虫测报站把三化螟蛾误认为二化螟蛾,而错误地作出了二化螟蚁螟盛孵高峰的预报,严重地影响了药剂治螟的效果。这是生产上的重
随着船舶尺度的增大,结构形式的不断发展,对于船长超过150米或者超出规范的结构形式来说,采用传统的梁理论和经验公式分析评估船体结构强度并不适用。近年来,计算机技术飞速
备课是当前教师教学中不可缺少的环节,备课电子化是当今教师备课改革的一种趋势,但目前教师在电子备课过程中,普遍存在备课资源缺乏、备课模式单一、备课目标不明、备课实用
《荆棘鸟》由澳大利亚作家考琳·麦卡洛创作,1977年《荆棘鸟》一经发表,作者便一举成名,迅速成为风靡全球的“国际畅销小说”。《荆棘鸟》是一本家世小说,以牧场主的女儿梅吉与罗
铝浆作为晶体硅电池背电极材料,主要由导电相、无机粘结相、添加剂、载体组成。这些组成部分都对铝浆的性能起到至关重要的影响。对各种组成成分的作用机理以及铝背场形成使