费氏中华根瘤菌HN01与硫代谢相关基因smrA、smrB和smrC的研究

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费氏中华根瘤菌HN01由于其生长速度快,胞外多糖少被用作共生固氮研究的模式菌株,也适合作为商业化生产的菌剂。本室先前的工作用Tn5gusA5对费氏中华根瘤菌HN01进行随机插入诱变,筛选得到一株瘤能力下降、结瘤时间延迟的突变体GXHN100。并得到了其插入位点所在的基因序列,将该基因命名为pmrA。通过原位杂交的方法,从费氏中华根瘤菌HN01基因组文库中钓出含有pmrA基因的阳性克隆pGXHN300。本工作的目的是在pmrA序列附近寻找新的与竞争结瘤有关的基因。 亚克隆测序得到pmrA两翼序列8kb。经生物信息学分析,包括七个完整的ORF和一个不完整ORF。取与pmrA转录方向相同的五个ORF:ORFa、ORFb、ORFc、ORFd(pmrA)ORFe进行研究。其中,ORFa与Rosarita Tare等人在Rhizobium etli发现一个类似于cysG的基因(CAA04958.1)在氨基酸水平一致性为79%,相似性为87%。Rhizobium etli中cysG突变体不能利用硫酸或亚硫酸,硝酸或亚硝酸为硫源和氮源。上株实验证明该突变体竞争结瘤能力下降。ORFc序列分析发现明显的与亚硫酸或亚硝酸还原相关的保守结构域。ORFd与DUF934有很高的一致性。DUF934是未知功能的细菌
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