中国的公共资源交易系统建立较晚，目前，公共资源交易系统改革仍属于初级阶段，很多地方公共资源交易系统的建立还不成熟。公共资源交易的整合错综复杂，地方差异性较大，制度体系不成熟，这些都不利于公共资源交易事业的发展。种种浪费国家资源、损害国家利益的现象频生，迫切地需要通过改革等手段来维护和完善公共资源交易体系。本文运用实证分析、比较分析和文献分析的方法，研究公共资源交易中的国家利益保护相关问题，针对国家利益在公共资源交易中的流失表现及原因，提出相应对策，为地方公共资源交易系统寻求实际、可行的公共资源交易运行提供较为可行、具有指导性的论文参考。　　本文总的分为三大部分。第一部分:分析国家利益保护与公共资源交易相关概念与两者之间的联系，包括对公共资源、公共资源交易、国家利益保护等具体概念的阐释等;第二部分:主要研究公共资源交易领域中出现的有关国家利益受损的情况，包括交易信息不对称、私下协议邀请招标、废标资本浪费现象等，并给予形成问题的原因分析，包括客观上新事物的发展尚需时间，主观管理上权力分配、权力干扰、废标资本评估等;第三部分:提出公共资源交易中保护国家利益的具体意见建议，如管理体制建设、加大制度性监督、杜绝腐败、规范公共资源交易管理。强调建立完善公共交易市场的正常秩序通过从废标追责管理规范化、评委队伍专业化、招投标单位约束制度化来着手。对公共资源交易管理部门提供可行性的措施建议，减少因监督不力而导致的国家利益受损。