随着新疾病不断涌现,耐药菌的逐渐增多,人类亟需加速新药开发。微生物来源的药物一直是新药发现的主要来源,但普通环境来源的微生物已经不能满足其要求,人们把更多的目光转移到极端环境微生物的研究上。嗜盐放线菌作为极端微生物资源的重要组成部分,蕴含着相当丰富而特殊的活性次级代谢产物。目前,长时间的研究已经积累了丰富的嗜盐放线菌物种,但是由于发酵产物不稳定等因素,嗜盐放线菌代谢产物上的研究显得相对滞后。基于前期分离的大量嗜盐放线菌上,首先建立了一个500株的待筛选的菌种库,进而提取其基因组DNA建立了DNA库。接下来选取4个类型天然产物关键基因,利用简并引物(Degenerate primers),通过巢式PCR扩增等设计并制作了地高辛标记的特异性探针,运用高通量技术对基因组DNA进行筛选,最终筛选出大量具有不同类型功能基因的阳性菌株,综合分析后发现,其中31株菌含有多种类型的功能基因,这样的潜力菌株可能具有产生多种化合物的能力,也可能含有新的化合物。为了进一步探索这些潜力菌株中蕴含的基因簇资源,本研究选取了2株最具潜力的菌株YIM96935和YIM96633进行全基因组测序；利用生物信息学软件进行分析,最终发现这2株菌可能分别含有5个和16个生物合成基因簇,部分基因簇与已知基因簇具有一定相似性,这些已知基因簇编码了多种不同类型的化合物,其中一些化合物具有较好的抗肿瘤、抗氧化、抗菌、抗炎症以及免疫抑制活性。大部分新基因簇与已知基因簇相似度较低,可能编码合成结构新颖的活性天然产物。此外本研究还对这2株潜力菌的异源表达进行了前期探索。本研究以嗜盐菌为对象,建立了适合该类菌株的高通量筛选方法,获得了潜力菌株并通过生物信息学证明了筛选方法的有效性,为部分解决该类资源开发难的难题奠定了坚实的基础。