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山羊关节炎—脑炎（CAE）是由反转录病毒科慢病毒属山羊关节炎脑炎病毒（CAEV）引起的山羊的慢性传染病，CAEV可引起潜伏感染并呈世界性分布，妨碍了世界养羊业的正常贸易，导致严重的经济损失。本研究通过对CAEV89-GB1026株全基因序列的分析，应用TaqMan PCR扩增技术，建立了CAEV快速、灵敏、特异的检测方法；同时通过重叠PCR和PCR扩增CAEV的外膜蛋白（SU）基因，构建了外膜蛋白SU的真核表达载体并进行了真核表达。在CA蛋白基因的高保守区分别设计了特异性的引物和探针，应用TaqManPCR扩增技术，采用ABI Prism7900HT荧光定量PCR仪，建立了pGEM T-CA1质粒拷贝数与Ct值得标准曲线，TaqMan PCR可在1h内检测102个拷贝的质粒，灵敏度与常规PCR相当。TaqMan PCR检测CAEV和其他动物病毒（比如，猪流感病毒、山羊痘病毒、牛白血病病毒、牛粘膜病病毒，尼帕病毒）无交叉反应，显示了良好的特异性；分别应用TaqMan PCR和常规PCR对来自陕西和天津的308份临床样品进行了检测，阳性率分别为7.8%和7.5%，结果显示所有PCR阴性的样品均为TaqMan PCR阴性，仅有1株PCR阴性的样品呈现TaqMan PCR阳性（16/48vs.17/48），两者一致性为99.7%。TaqMan PCR敏感特异可用于检测感染动物全血和外周血淋巴细胞中CAEV原病毒基因组DNA。根据完整env序列以及pGEM T-CA4和pGEM T-CA5序列的情况，用生物信息学软件oligo6.0分别设计两套引物，分别采用PCR和overlap PCR方法对env基因进行完整克隆；结合测序后的序列和信号肽预测分析，设计CAEV外膜蛋白（SU）基因的表达引物，构建了重组真核表达质粒pCDNA4.0-SU,转染BHK-21细胞系，在200μ g/mL的Zeocin培养基筛选下获得真核表达，并用间接免疫荧光对其进行了初步鉴定。