海域使用权流转制度的建立是新时期“海洋强国战略”实施的重要组成部分，文章在论述海域使用权流转性质的基础上，重点分析海域使用权一、二级市场的流转方式，剖析其不足，并针对此些不足，提出相应的解决对策，以期夯实海域使用权流转制度的建构。第一部分，从宏观和微观的角度分析海域使用权的流转。宏观方面是从经济法和环境资源法的角度来分析海域使用权流转的基本原理；微观方面是从海域使用权流转本身的性质入手进行分析，使之与民法区分开来，显示经济法的特色。第二部分，在理论和实践两个层面，分析海域使用权一级市场的流转制度。首先，概括介绍了一级市场的主要流转方式；其次，对各主要流转方式进行比较分析；再次，分析一级市场的限制条件；最后，指出流转过程中存在的问题。第三部分，分析海域使用权二级市场的流转制度，包括主要流转方式、流转过程中的限制性条件，以及流转过程中存在的问题。第四部分，是海域使用权流转制度的完善。首先，从法律层面上，重点提出完善建议，实现立法跨越式转型的实现；其次，把评价、评估制度引入海域使用权流转制度，推进海域使用权流转制度的构建；最后，从科学管理方面，完善海域使用权流转制度。