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思茅松是卡西亚松的地理变种。本研究对思茅松11个居群开展了球果、种子和种翅形态性状和DALP分子标记的调查和分析，试图从形态学和分子水平探讨其居群遗传变异和遗传结构。主要研究结果如下：
1.对思茅松11个居群雌球果、种子和种翅24个形态性状进行了研究，并与云南松1个居群作对比。结果表明，思茅松球果10个性状变异系数(CV)的取值范围很广，主要集中分布在5％～12％；居群间表型频率分化系数Pst为14.66％；居群间表型方差分化系数Vst为38.97％。思茅松种子和种翅12个性状变异系数(CV)主要集中分布在6％～17％；居群间表型频率分化系数Pst为7.40％；居群间表型方差分化系数Vst为50.03％。思茅松居群间球果性状表型频率分化系数大于种子和种翅，表明思茅松居群间球果性状表型频率分化大于种子和种翅；思茅松居群间球果性状表型方差分化系数小于种子和种翅，表明思茅松居群间球果性状表型分化显著小于种子和种翅；思茅松居群间球果、种子和种翅性状表型频率分化系数均较小，表明思茅松球果、种子和种翅性状表型频率主要分布于居群内个体间。
利用居群间欧氏距离进行Q-聚类分析表明，思茅松球果、种子和种翅的形态性状分化，基本与居群间的地理距离远近相关联。思茅松球果、种子和种翅22个表型性状间多数呈极显著或显著的正相关。球果长、球果直径、球果干重，种翅长、宽、周长，种子长和宽以及重量，为思茅松球果、种子和种翅易测定和重要的表型性状。
2.思茅松形态丰富的多态性有一定的生存适应意义。球果和种子大小及重量变化多样，决定种子不同的营养状况、萌发能力及散布能力，对幼苗的定居和存活起决定作用。种翅色彩变异与生境背景色调相协调，形成一种拟态保护。种子和种翅大小及形状丰富的多态性，与思茅松基因流动有密切关系。
3.采用DALP(Direct amplification of length polymorphism)检测思茅松11个居群遗传结构，并与1个云南松居群相比较。5个引物组合共检测到278个条带，其中272个为多态位点，多态位点百分比PPB为97.84％。11个居群总的观察等位基因数Na是1.9784，平均Na是1.4179；总的有效等位基因数Ne是1.4514，平均Ne是1.2456；Nei’s基因多样性指数H为0.2793，平均0.1459；总的Shannon多样性指数I为0.4345，平均0.2197。总的基因多样性指数Ht为0.2793，居群内多样性指Hs为0.1459，居群间基因分化系数Gst为0.4775，即居群间存在较大的遗传分化。也就是说，思茅松约有47.75％的遗传变异来自居群之间，52.25％来自居群内，居群内分化较居群间显著。
总之，思茅松形态和分子遗传方面的变异均十分丰富，具有很强的适应性和进化潜力。