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盐酸克伦特罗作为β-兴奋剂的一种有害于人的健康在用于改善猪肉品质时,为了理解在盐酸克伦特罗作用下间接或直接影响到那些基因从而很大程度上提高了瘦肉率、降低了脂肪率,因此我们用基因芯片技术分析了盐酸克伦特罗处理的猪的脂肪组织以及肌肉组织基因的差异表达。本实验我们首先创建了代表大约3500个用于功能基因组分析的猪基因微阵列。阵列中的元素来自6494个大规模表达序列标签的cDNA克隆,这些cDNA克隆来自均一化和消减后的猪脂肪cDNA文库。通过BLASTN进行序列相似性搜索,在阵列中的3426个ESTs中比对出2790个ESTs是和人的同源,占81.4%,其余的是代表新基因或高度非同源的ESTs。我们用自己建立的这个功能基因组分析的技术平台——cDNA Microarray分析的主要结果如下: (1)、分析了脂肪型的香猪和瘦肉型的大白猪两个品种的脂肪组织的基因的差异表达,得到了被诱导或被抑制的差异表达基因共有72个。通过对这72个差异表达的基因进行生物信息学分析发现16个基因与脂肪代谢相关、2个基因与细胞机体防御相关、3个基因与基因表达和蛋白合成相关、6个基因和细胞信号转导相关。剩余的34个是在数据库中没有注解的ESTs,11个是代表新基因的ESTs。 (2)、分析了用盐酸克伦特罗刺激的三月龄时的香猪实验组与对照组脂肪组织的基因的差异表达,得到了大于两倍以上被诱导或被抑制的差异表达基因共有70个,通过对这70个差异表达的基因进行生物信息学分析发现13个基因与脂肪代谢相关、2个基因与细胞机体防御相关、8个基因与基因表达和蛋白合成相关、2个基因和细胞信号传导相关、9个基因和细胞结构和迁移有关。剩余的20个是在数据库中没有注解的ESTs,16个是代表新基因的ESTs。 (3)、分析了用盐酸克伦特罗刺激的四月龄时的香猪实验组与对照组脂肪组织的基因的差异表达,得到了大于两倍以上被诱导或被抑制的差异表达基因共有77个,通过对这77个差异表达的基因进行生物信息学分析发现15个基因与脂肪代谢相关、8个基因与基因表达和蛋白合成相关、1个基因和细胞信号传导相关、10个基因和细胞结构和迁移有关。剩余的32个是在数据库中没有注解的ESTs,11个是代表新基因的ESTs。 (4)、分析了用盐酸克伦特罗刺激的成年大白实验组与对照组脂肪组织的基因的差异表达,得到了大于两倍以上被诱导或被抑制的差异表达基因共有107个,通过对这107个差异表达的基因进行生物信息学分析发现25个基因与脂肪代谢相关、2个基因与基因表达和蛋白合成相关、5个基因和细胞信号传导相关、1个基因和细胞结构和迁移有关、4个基因与细胞机体防御相关。剩余的53个是在数据库中没有注解的ESTs,17个是代表新基因的ESTs。 (5)、分析了用盐酸克伦特罗刺激的香猪实验组与对照组肌肉组织的基因的差异表达,得到了大于两倍以上被诱导或被抑制的差异表达基因共有183个,其中有8个是与细胞机体防御相关,3个是和细胞分裂相关,10个是和细胞信号传导相关,8个和细胞结构迁移相关,27个和基因表达和蛋白合成相关,15个和脂肪代谢相关,72个是没有注解的ESTs以及40个是代表新基因的ESTs。 通过对上面差异表达的基因的生物信息学的分析,我们找到了实验重复和芯片重复之间共表达的基因23个,他们分别是与脂肪形成和和脂肪代谢、脂形成相关的重要的转录因子、几个阿中国农业大学博士学位论文中文摘要也鱼里里里里里里旦旦里鱼旦里里旦里鱼鱼鱼鱼旦旦旦鱼鱼旦里鱼鱼旦鱼旦鱼旦里里旦鱼鱼理旦里鱼旦旦鱼旦里鱼鱼旦鱼旦里鱼鱼旦旦旦旦鱼里旦鱼旦旦鱼鱼旦鱼鱼旦鱼旦旦旦旦鱼里里里里旦里里里里里里里里里里朴脂蛋白家族中的基因以及日一兴奋剂调节的胞内信号路径中的几个基因相关。另外,我们还找到了20个未知功能的新基因。这些基因很可能与盐酸克伦特罗的刺激有关,因此用这些基因来改善猪的肉质性状在短时间内可能收到好的效果,并且如果可行,我们能够找到一种对人类健康无害的药物代替盐酸克伦特罗的使用。同时我们的研究也能为人类攻克肥胖症提供新视野。最后我们的实验结果也显示出用微阵列技术来研究猪的发育、疾病抗性、营养和繁殖性状的可行性。