Micro-RNA-146A与汉族人群系统性红斑狼疮遗传易感性的关联分析

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研究背景系统性红斑狼疮(SLE)是一种临床表现多样化、可累及多个系统的自身免疫性疾病。SLE发病机制尚未明确,是一种多基因病,目前认为与遗传、免疫、病毒感染、药物及激素等因素有关,其中遗传因素在SLE的发病中发挥重要作用。过去二十年,各研究小组主要通过全基因组扫描和候选基因的方法研究SLE的易感基因,但多数结果不尽一致。在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库收录的13个SLE易感基因位点中有11个是通过连锁分析和全基因组扫描发现的,分别是1q41-42(SLEB1)、2q37.3(SLEB2)、4p16-15.2(SLEB3)、12q24(SLEB4)、13q32(SLEB5)、16q11.2(SLEB6)、20p12(SLEB7)、20q13.1(SLEB8)、1q32(SLEB9)、7q32(SLEB10)、2q32.2-q32.3(SLEB11)。通过精细定位和候选基因的方法发现了一些可能与SLE相关的易感基因,如PTPN22、CRP、FCGR2A、FCGR3A、FCGR2B、STAT4、IRF5、TLR5、ITGAM-ITGAX、FAS、PARP、PDCD1、HLA-DRB1、C2、C4等。近年来随着国际单体图型计划(HapMap)的完成和廉价高效的高通量基因分型技术的出现,全基因组关联分析(GWAS)已成为寻找复杂疾病易感基因最有效的方法。目前已开展了多个SLE易感基因的GWAS研究,其中Harley等报道表明在欧洲人群中5q33.3上的单核苷酸多态性(SNP)rs2431697与SLE相关(P = 1.00×10-10,OR= 1.22),由于不同种族之间的遗传异质性是SLE发病风险的重要因素,因此值得进一步研究来确定rs2431697是否与其他人群SLE相关。本研究对1993例SLE患者和4770例健康对照(均是汉族人)的SNP rs2431697进行基因分型,探讨5q33.3上的单核苷酸多态性(SNP)rs2431697与汉族人SLE易感性的相关性。此外,通过研究风险相关的SNPrs2431697重组和连锁不平衡(LD)模式,进一步探寻5q33.3区域内的SLE易感基因。目的研究5q33.3上的单核苷酸多态性(SNP)rs2431697与汉族人SLE易感性的相关性。探寻5q33.3区域内的SLE易感基因。方法利用Sequin MassArray平台对1993例SLE病例和4770例对照的SNP rs2431697位点进行基因型分型。使用MassARRAY Typer软件对SNP rs2431697分型数据进行质谱图分析。风险相关的SNPrs2431697重组和连锁不平衡(LD)模式。结果rs2431697与中国汉族人群SLE存在明显关联性(P=6.27×10-11,OR= 1.43,95%CI:1.28 - 1.59)。与欧洲研究结果相比,汉族人群rs2431697位点具有更高的风险等位基因频率(87.16%vs 61.52%)以及关联性更强(OR: 1.43 vs 1.22)。SNP rs2431697关联信号位于一大约100kb LD区域,该区域只包含基因微RNA-146A(MIR146A)。结论5q33.3上的SNP rs2431697与汉族人群SLE的易感性相关, 5q33.3区域内的SLE易感基因可能为Micro-RNA - 146A(MIR146A)。
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