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以2009年2月份采集于我国海南、广西、广东、福建四省区的东寨港、北海、和安、调风、附城、高桥、特呈岛、东北大堤、福田、珠海、云霄、泉州湾等共12个地区的15个秋茄种群成熟胎生苗为材料,采用沙基培养,定期浇灌盐度为15‰的天然海水,模拟正常生长条件的方法分析秋茄幼苗生长量、光合作用、叶绿素含量、叶片游离脯氨酸含量和过氧化物酶(POD)活性。并在五个不同温度处理下,分析了秋茄幼苗电导率的变化,探讨了不同秋茄种群的耐寒性差别。采用表型性状、SRAP分子标记技术、表型性状+SRAP标记的方法对15个秋茄种群的遗传多样性进行研究,并探讨了三种遗传多样性分析方法之间的异同以及种群遗传多样性和耐寒性之间的关系。目的在于为将来红树林引种和恢复以及更好的保护珍贵的秋茄种质资源提供科学依据。主要研究结果如下:1.对比分析表明不同地区不同种群的秋茄胎生苗在长度、直径、生长量均存在明显差别,而同一地区不同种群之间则无明显差别。2.采用改良的CTAB抽提方法,成功的从秋茄叶片中提取和纯化了基因组DNA,获得了质量状况良好的DNA片段,适宜于进行PCR扩增。说明改良的CTAB抽提方法,能很好的适用于富含多糖、脂类、单宁等物质的红树植物基因组DNA的提取与纯化。运用SRAP分子标记对15个秋茄种群进行遗传多样性分析,选用46对引物,共扩增出270条清晰可读条带,其中多态性条带107条,占总带数的39.63 %,平均每个引物组合产生5.9条带和2.3条多态性条带。采用表型性状、SRAP分子标记和表型性状+SRAP三种方法分析了我国东南沿海地区秋茄种群遗传多样性。三种分析结果(表型、SRAP、表型+SRAP)的遗传距离变化范围分别为1.11～8.94、11.21～31.61和6.92～22.27;平均遗传距离分别为4.20、14.13和21.14,表明我国东南沿海地区秋茄种群存在较大的遗传分化。三种方法分析表明用SRAP分子标记和表型性状+SRAP得到的聚类结果具有较高的相似程度和较高的遗传多样性,因此在秋茄遗传多样性分析中可以采用SRAP分子标记或者表型性状+SRAP进行分析。聚类分析表明15个秋茄种群的遗传分化与中国东南沿海的地理隔离远近的关系并不明显。3.各种群秋茄幼苗在光合指标上存在较大差别。净光合速率、气孔导度、胞间CO2浓度、蒸腾速率的平均值分别为:7.08(μmolCO2.m-2.s-1)、0.134(molH2O.m-2.s-1)、257.67(μmolCO2.m-2.s-1)、3.94(molH2O.m-2.s-1) ;变化范围分别为5.25～9.63(μmolCO2.m-2.s-1),0.072～0.220 (molH2O.m-2.s-1), 182.00～324.20 (μmolCO2.m-2.s-1),1.92～6.164 (mol H2O.m-2.s-1)。偏向关性分析表明,净光合速率与气孔导度呈极显著正相关(r=0.681**)、与胞间CO2浓度呈极显著负相关(r=-0.764**)、与蒸腾速率呈显著负相关(r=-0.245*);气孔导度与胞间CO2浓度(r=0.638**)以及蒸腾速率(r=0.682**)有极显著相关性;胞间CO2浓度与蒸腾速率(r=-0.047)相关性不显著。方差分析表明,15个种群之间净光合速率指标差异性不显著,气孔导度、胞间CO2浓度、蒸腾速率均呈现出极显著差异。光合作用分析表明各秋茄种群幼苗都没有明显的光合午休现象。4.模拟正常生长条件下,不同秋茄种群幼苗100天内的生长量变化、光合作用日变化、叶绿素含量、叶片游离脯氨酸含量和过氧化物酶(POD)活性具有显著差异。在五个不同的温度(-5℃、0℃、5℃、10℃、28℃)处理下,各种群秋茄幼苗叶片均呈现出随着温度的降低电解质相对外渗率逐渐增大的趋势,但不同种群之间的这种变化趋势有所不同。10℃时,福田1、福田2两种电解质相对外渗率发生明显变化;当温度降低到5℃时,绝大部分种群电解质相对外渗率明显升高,表明在此温度下秋茄开始显现冷害状况。实验数据综合评价表明:福田1、附城、泉州湾、调风四个种群秋茄幼苗在湛江地区的生长态势最好,同时也最抗寒。这四个种群的生长状况顺序为:福田2>泉州湾>调风>附城,耐寒性顺序为:调风>附城>福田2>泉州湾。