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我们首次在被称为“世界第三极”的青藏高原发现植物研究的模式种拟南芥。 本次研究首先在拟南芥发现的基础上探讨了关于生态型鉴定和划分的方法；并根据现有方法从表型、海拔、系统进化树和SINEs分子标记等方面提出在青藏高原发现的拟南芥很有可能是一种新的拟南芥生态型。 其次在对拟南芥西藏个体全基因组测序的基础上以Col_0为参考，提取拟南芥西藏个体的131个SINEs序列，统计出在已知全基因序列的20个拟南芥生态型中的每个SINE的存在和缺失，筛选出至少在一个拟南芥生态型中有缺失的40个SINEs。并以此为基础，筛选出两组SINEs的组合可以将这20个拟南芥生态型区分开。 最后在全基因组测序的基础上，针对全基因组测序结果中缺失或存在gap的30个SINEs以Can_0或Bur_0的全基因组序列中的SINEs为模板，在SINE前后100-800bp范围内设计引物，扩增出相应的片段并送测序。拿到的测序结果与全基因组测序结果进行比较，进一步验证全基因组测序的准备性并获得全基因测序未读到的序列信息。