论文部分内容阅读
目的筛查新生儿TLR4基因的多态性位点(SNP),并进一步检测SNP与新生儿G-菌感染的相关性。方法取上海地区出生的汉族新生儿外周血0.5 ml,依次进行DNA提取、聚合酶链反应(PCR)和基因测序检测SNP位点;组与组之间的连续性变量比较应用方差分析,计数资料采用卡方检验。结果共检测上海地区出生的465例汉族新生儿,包括早产儿205例(26~32周早产儿133例,33~36周早产儿172例)和足月儿160例;其中G-菌感染186例,非感染279例;极低出生体重儿68例,低出生体重儿274例,小于胎龄儿96例。1、TLR4常见的SNP位点集中在启动子部位6个位点,包括T-1418C、A-1837G、G-1892A、-2242C、A-2381G、A-2415G,未发现在欧美人群比较常见的编码区SNP位点。2、465例新生儿均进行了上述6个SNP位点的检测,其中345例新生儿具有上述一个或多个SNP位点(SNP组),120例没有发现上述SNP位点(非SNP组):(1)SNP与G-菌感染:早产儿中,SNP组G-菌感染率为41.8%(94/225),非SNP组为25%(20/80),两组之间差异有显著性意义(P=0.008,OR=2.153),足月儿两组之间差异无显著性意义;低出生体重儿中,SNP组G-菌感染率为45.8%(93/203),非SNP组为23.9%(17/71),两组之间差异有显著性意义(P=0.001,OR=2.686),而足月儿以及BW>2500g的新生儿,SNP组和非SNP组之间差异无显著性意义。465例不同胎龄的新生儿,A-2381G的A/A基因型组,G-菌感染率为33.7%(56/166),而非A/A基因型组感染率为43.4%(130/299),两组之间差异有显著性意义(P=0.040,OR=0.662);根据胎龄不同分层检验:GA<33w的新生儿,A-2381G的A/A基因型组感染率为41.3%(19/46),而非A/A基因型组感染率为59.8%(52/87),两组之间差异有显著性意义(P=0.042);胎龄33-36w早产儿,A-1837G的A/A基因型组感染率为15.6%(10/64),而非A/A基因型组感染率为30.6%(33/108),两组差异有显著性意义(P=0.029),足月儿人群中没有发现启动子各SNP位点与G-菌感染存在相关性;根据出生体重不同进行分层检验:出生体重<1500g的新生儿,T-1418C的T/T基因型组感染率为61%(25/41),而非T/T基因型组感染率为85.2%(23/27),两组之间差异有显著性意义(P=0.032,OR=0.272;A-1837G的G/G基因型组感染率为100%(10/10),而非G/G基因型组感染率为65.5%(38/58),两组之间差异有显著性意义(P=0.027,OR=1.526);A-2415G的G/G基因型组感染率为100%(12/12),而非G/G基因型组感染率为64.2%(36/56),两组差异有显著性意义(P=0.014,OR=1.556);BW:1500~2500g的新生儿,A-1837G的A/A基因型组感染率为18.8%(13/69),而非A/A基因型组感染率35.8%(49/137),两组差异有显著性意义(P=0.012,OR=0.417);T-2242C的T/T基因型组感染率为20.5%(15/73),而非T/T基因型组感染率为35.3%(47/133),两组差异有显著性意义(P=0.027,OR=0.473);A-2381G的A/A基因型组感染率为18.4%(14/76),而非A/A基因型组感染率为36.9%(48/130),两组有差异有显著性意义(P=0.005,OR=0.386);A-2415G的A/A基因型组感染率为20.3%(15/74),而非A/A基因型组感染率为35.6%(47/132),两组差异有显著性意义(P=0.021,OR=0.460);对于BW>2500g的新生儿,没有发现TLR4启动子部位各SNP位点与G-菌感染存在相关性。(2)SNP与早产的相关性:启动子部位常见的6种SNP位点不同基因型组早产率无统计学差异(P>0.1)。(3)SNP与出生体重的相关性:T-2242C的C/C基因型组极低出生体重儿的发生率为18.8%(15/80),低出生体重儿的发生率为73.8%(59/80),而其他基因型极低出生体重儿的发生率为13.8%(53/385),低出生体重的发生率为55.8%(215/385),R×C表卡方检验P=0.012。C/C基因型组体重为2170.3±722.2g;非C/C基因型组体重为2402.7±822.6g;两组差异有显著性意义(P=0.019)。(4)SNP与宫内发育迟缓的相关性:465例不同胎龄的新生儿,6个SNP位点各基因型对应的SGA发生率差异无显著性意义;根据胎龄不同分层检验,结果显示:早产儿TLR4启动子部位常见的SNP位点不同基因型人群SGA的发生率无明显差异;足月儿中,T-1418C的C/C基因型人群SGA的发生率为50%(5/10),T/C杂合子人群SGA的发生率为27.1%(16/59),T/T基因型为15.8%(13/82),三组之间差异有显著性意义,P=0.028;C/C基因型是SGA的高危因素,OR=3.862,T/T则是SGA的对抗因素,OR=0.431;G-1892A的G/G基因型SGA的发生率为15.9%(14/88),而非G/G基因型SGA的发生率为31.7%(20/63),两组之间差异有显著性意义(P=0.022),G/G基因型表现为SGA的对抗因素,OR=0.407;足月儿中,T-1418C的C/C基因型组体重为2994.1±653.9g;T/C组体重为3165.5±455.1g,T/T组体重为3251.7±557.4g;三组之间差异有显著性意义;G-1892A的A/A基因型组体重为2838.0±546.0g;G/A:3201.2±529.1g;G/G:3276.2±552.2g;三组之间差异有显著性意义(P=0.024)结论TLR4基因多态性存在明显的种族差异性,我国汉族新生儿人群中常见的SNP位点集中在启动子部位,编码区SNP的频率分布偏低;启动子部位常见的6个SNP位点可能与G-菌感染、低出生体重和宫内发育迟缓等存在相关性。