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舟形藻属(Navicula Bory)隶属于硅藻门,羽纹纲,舟形藻目,舟形藻科,是硅藻门中种类比较丰富的类群之一。全世界已报道舟形藻属(Navicula)植物9800多个分类单位。目前,该属内部分种类的归属较为混乱,在分类学上存在较多争议,分类难度较大。本研究对野外采集到的部分舟形藻属种类进行了单克隆株系培养,同时借助光学显微镜(LM)和扫描电子显微镜(SEM)对培养的舟形藻属(Navicula)的种类进行形态学特征观察并鉴定。结合分子系统学研究对已分离藻株的18S、rbcL、28S基因进行测序分析,通过构建其贝叶斯进化树和最大似然进化树,确定各个种类在系统发育树中的位置,结果如下:1.对成功分离培养的舟形藻属及其邻近属种类进行了形态学研究,共鉴定舟形藻属硅藻10个分类单位,鞍形藻属硅藻1个分类单位,羽纹藻属硅藻2个分类单位。对每个种的形态学特征、生境分布等信息进行了描述与整理。2.使用核糖体基因(18S、28S)和叶绿体基因(rbcL)构建舟形藻属系统发育树,结果表明:(1)基于各个基因序列构建的进化树的结果同形态分类学的结论基本吻合。(2)基于18S、rbcL和28S基因构建的系统进化树,我们发现舟形藻属始终和鞍形藻属(Sellaphora)聚在一大支,据此推测舟形藻属和鞍形藻属具有较近的亲缘关系;原属于舟形藻属的Navicula tridentula并没有与舟形藻属聚在一支,而是和鞍形藻属聚为一支,结合形态学研究结果和分子系统学的证据,我们的结果支持了Wetzel et al.(2015)的结论,将N.tridentula转移到鞍形藻属中。(3)基于18S和28S基因构建的系统进化树在舟形藻属及其邻近种间具有较强的支持率和较好的区分度,可作为硅藻分子系统学较好的分子标记。3.利用分子系统学手段对已分离培养的双壳缝类藻株的rbcL基因进行测序分析,并与NCBI上下载的其他双壳缝类硅藻进行比对,通过构建其贝叶斯进化树和最大似然进化树,确定各个种类在系统发育树中的位置,分析结果表明:在属的水平上,我们的研究结果支持现行分类系统中双壳缝类硅藻属的划分;在科的水平上,我们的结果更支持Cox(2015)分类系统的观点。具体结论如下:(1)以梅尼小环藻(Cyclotella meneghiniana)为外类群构建的系统进化树中,双壳缝的种类均聚在一个大支上,表明双壳缝类整体上是亲缘关系较近的一个大类群。(2)根据本研究进化树的分析结果,舟形藻属(Navicula)、半舟藻属(Seminavis)、布纹藻属(Gyrosigma)同其他属距离较远,因此支持Cox分类系统中将这三个属划分为一个科的结论;鞍型藻属(Sellaphora)、曲解藻属(Fallacia)同其他属分开,也支持Cox和Round(1990)的分类系统中两者为同一科的观点;羽纹藻属(Pinnularia)与美壁藻属(Caloneis)聚在一起,表明两者具有较近的亲缘关系,也在一定程度上支持了Round分类系统中认为二者应归为一个属的观点。此外,辐节藻属(Stauroneis)同柳条藻属(Craticula)聚在一起,长篦藻属(Neidium)同Neidiomorpha属聚在一起,双眉藻属(Amphora)同肋缝藻属(Frustulia)聚在一起,异极藻属(Gomphonema)同异楔藻属(Gomphoneis)聚在一起,这些分子系统学证据都在一定程度上支持了Cox和Round的分类观点。(3)我们构建的进化树中,桥弯类和异极类硅藻聚在一支,表明这两个类群具有较近的亲缘关系。其中桥弯藻属(Cymbella)和内丝藻属(Encyonema)的种类混淆在一起,虽然这两个属在形态上具有明显的差异,但在Patrick&Reimer(1975)的分类系统中,内丝藻属(Encyonema)原属于桥弯藻属(Cymbella),因此,二者之间的演化关系还需要进一步深入研究。瑞氏藻属(Reimeria)同异极藻类聚在一支,表明两者具有较近的亲缘关系,这同Round的分类观点不同,但支持了Cox的分类学观点。