为更好的进行产学研协同创新研究，适应当下对于创新型社会发展的新形势，本文对相关文献进行全面梳理总结，并在现有的产学研协同创新研究中，融入生态系统的概念，将创新生态系统分为内围核心子系统和外围环境子系统，分别剖析了两个子系统的内部构成及各要素的内涵和作用。针对其中的关键概念“产学研协同度”，在复合协同度模型及熵理论基础下的三螺旋模型基础上构建产学研协同度模型，从投入协同度和产出协同度两个维度来度量产学研协同度。运用数据挖掘和检索的方法获得创新生态系统中各要素的度量数据，并运用SPSS回归分析的方法对2013年全国31省市（港澳台除外）数据进行主效应分析和调节效应分析，研究了各创新群落的协同度以及创新环境调节效应对区域创新产出的影响，发现产学研协同度对区域创新产出有正向影响，并在外围环境子系统所涉及的各要素调节作用下加强，其中政府资金环境与技术中介环境为负向调节，而基础设施环境为正向调节作用，人文环境的调节效应则相对并不显著。根据理论研究和实证结果，从构建资源平台、打通协调机制等方面提出了促进区域创新产出的建议。