大庆盐碱土可培养嗜盐细菌与古菌的多样性及多相分类研究

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嗜盐菌由于具有独特的生理结构、遗传特性和代谢机制而引起国内外学者的广泛重视,是一类极具基础研究价值和开发应用前景的微生物资源。开发新的嗜盐菌种资源对于深入揭示嗜盐微生物的耐盐机制,发现新的耐盐相关基因,以及改造作物、改良利用盐碱地等方面具有重要意义。我国地域辽阔,海岸线漫长,存在大面积的盐碱地和众多盐湖,为嗜盐微生物的分离和系统分类工作的展开提供了得天独厚的条件。  本研究以黑龙江省大庆市典型苏打盐碱土作为研究对象,进行嗜盐微生物的分离和多相分类研究。采用稀释平板法,对盐碱地表层土壤样本(0~15cm)进行嗜盐微生物的分离和纯化,获得47株中度嗜盐细菌和10株极端嗜盐古菌。基于16S rDNA基因序列的系统进化分析表明,中度嗜盐细菌菌株分布在碱杆菌属(Alkalibacillus),芽孢杆菌属(Bacillus)和盐单胞菌属(Halomonas),极端嗜盐古菌属于盐陆生菌属(Haloterrigena)。分离株15-13T和JX313T分别是盐单胞菌属(Halomonas)和盐陆生菌属(Haloterrigena)潜在的新种。  采用形态特征观察、生理生化特性测定、细胞化学组分及基因型数据的分析等多相分类技术对分离株15-13T和JX313T进行分类地位的确定。研究结果表明,分离获得的中度嗜盐细菌菌株15-13T为革兰氏阴性的杆状,借助于2~3根侧生鞭毛运动;生长盐度范围1~23% NaCl(w/v)(最适7%),生长温度范围20~50℃(最适35℃),生长pH范围7.0~11.0(最适pH9.5);主要的脂肪酸为C18:1ω7c(60.48%),C16:0(13.96%);基因组DNA G+C含量为67.6mol%;系统发育分析表明菌株15-13T是盐单胞菌科(Halomonadaceae)盐单胞菌属(Halomonas)的成员,与已知的潘泰莱亚盐单胞菌(Halomonas pantelleriensis) DSM9661T的系统发育关系最近(98.9%的16S rRNA基因序列相似性),DNA-DNA杂交试验显示两者之间的同源性为33.8%。结合表型特征、脂肪酸类型和基因型特征,确定菌株15-13T为盐单胞菌属(Halomonas)的新种,命名为耐碱盐单胞菌(Halomonas alkalitolerans sp.nov.),模式菌株为15-13T(=CGMCC1.9129T=NBRC106539T)。  极端嗜盐古菌菌株JX313T细胞为球形,革兰氏阴性,不运动,在蒸馏水中细胞不破壁,在固体培养基上生长7天后产生橙色色素;生长盐度范围可从10%NaCl(w/v)浓度至所在培养基中盐浓度达饱和,最适NaCl浓度为17.5%,生长温度范围20~50℃(最适35℃),生长pH范围8.0~11.0(最适pH10.0),基因组DNA G+C含量为59.3mol%。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,JX313T与盐陆生菌属(Haloterrigena)和钠线菌属(Natrinema)的成员相关,亲缘关系最近的种为盐田盐陆生菌(Haloterrigena salina)JCM13891T(96.2%的序列相似性)和伊斯巴尼亚盐陆生菌(Haloterrigena hispanica)DSM18328T(96.2%),进一步的DNA-DNA杂交试验显示 JX313T与盐陆生菌属(Haloterrigena)和钠线菌属(Natrinema)的相关种之间的同源性低于50%。此外,JX313T的最主要极性脂为phosphatidylglycerol(PG)、phosphatidylglycerol phosphate methyl ester(PGP-Me)和mannose-2,6-disulfate(1→2)-glucose glycerol diether(S2-DGD),符合盐陆生菌属(Haloterrigena)的极性脂特征。因此,系统进化分析、表型鉴定和化学分类数据表明菌株 JX313T为盐陆生菌属(Haloterrigena)的新种,并将其命名为大庆盐陆生菌( Haloterrigena daqingensis sp.nov.),模式菌株为JX313T(=CGMCC1.8909T=NBRC105739T)。在菌株JX313多相分类研究的基础上,提出对盐陆生菌属(Haloterrigena)特征描述的修改。
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