自上世纪三十年代以来，中国的鱼类学家对海南岛鱼类区系做了多次调查，然而，对于鱼类多样性格局的综合分析相对较少，这限制了海南岛鱼类多样性保护策略的科学制定。　　 本文对海南岛淡水鱼类多样性作综合分析，并且利用地理信息系统（GIS）技术对影响海南淡水鱼类分布格局的自然因素进行提取，结合流域面积、海拔、坡降、和人文因素综合分析淡水鱼所在生境。对海南岛保护区对鱼类多样性的保护状况进行了调查，根据十大流域淡水鱼类的状况排出保护的优先性，进行海南岛淡水鱼类保护单元的划分。最后从淡水鱼多样性所受的威胁、濒危原因、保护现状和保护空缺方面总体评价目前海南岛淡水鱼的保护状况，提出相应的保护策略。　　 首先，本研究分析了海南岛淡水鱼类物种多样性的信息。通过调查记录结合文献记载海南岛共有106种（亚种）淡水鱼类，其中有10种是海南省特有种。本文根据海南省十大水系淡水鱼的分布状况，结合在九个自然保护区内鱼类的调查状况，提出海南岛淡水鱼多样性分布格局的新观点，对传统上按照昌化江、南渡江、万泉河三大水系划分淡水鱼多样性分布水系的观点提出质疑。　　 我们把海南省十大水系内淡水鱼类主要划分为两大单元，即：山地河源单元和丘陵、台地河源单元。山地河源单元又划分为：山地江河单元和山地河流单元。丘陵、台地河源单元又划分为丘陵河流单元和台地河流单元。自然保护区内淡水鱼类所在水系也划分为两大单元，主要是：万泉河、陵水河与太阳东部单元，和南渡江、昌化江西部单元。这主要是与五大水系的地理位置相互关联的。位于东部单元中的万泉河、陵水河为一类，太阳河为一类。这主要是与水系的河源有关。淡水鱼类生态单元的划分对淡水鱼类多样性的保护提供了基础。　　 其次，本研究利用ArcGIS9.2软件对影响海南岛淡水鱼类多样性分布格局的物理因子进行了提取。对提取的影响淡水鱼类多样性物理因子进行主成分分析，同时结合淡水鱼的生态习性做相关性分析，最后找出影响淡水鱼多样性格局的主要因子。结果表明低海拔地区的淡水鱼类物种数高于高海拔地区，特有种物种数占总物种数的比例在中海拔高度出现峰值；集雨面积、干流长度、干流坡降这些因子主要影响淡水鱼的多样性。　　 第三，总结出海南岛淡水鱼类所受的威胁和现在的保护状况。水利工程建设是海南岛淡水鱼类多样性产生影响最大的一个威胁因素。鱼类受大坝、水电站的影响最大。恢复海南岛淡水鱼类多样性，保护鱼类的生境是关键。迄今为止，海南省众多保护区中还没有一个专门保护淡水鱼类的自然保护区，本研究提出很有必要在海南岛建立淡水鱼类资源生态保护区，以达到恢复淡水鱼类多样性之目的。