春性甘蓝型油菜遗传连锁图谱构建及开花时间的QTL定位分析

来源 :青海大学 | 被引量 : 14次 | 上传用户:jayzhoujian
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在甘蓝型油菜中,开花时间是一个重要的数量性状,油菜开花时间与种子成熟、产量、品质等都有很大的关系,植物在合适的时机开花对于避开自然的不利因素和产生更多的后代有重要的意义。在高海拔春油菜区,主要种植白菜型油菜,比起白菜型油菜,甘蓝型油菜在产量、抗性和含油量等方面都具有优势,但甘蓝型油菜在高海拔地区无法成熟,如果能选育出在高海拔区能正常成熟的早熟性甘蓝型油菜来替代白菜型油菜,白菜型油菜产区的油菜产量势必会大大提高,本研究通过对开花时间进行QTL定位和分析,开发主效紧密连锁标记,旨在为后期早花基因聚合和辅助育种提供理论指导。主要研究内容如下:1.通过小孢子培养研究了不同基因型,不同加倍方法及单倍体苗移栽环境对单倍体苗成活率和加倍成功率的影响,在三种不同加倍方法中,泡根方法的加倍率是最高的,为90.9%,对从单倍体苗的损失率来看,泡根方式也是最高的,综合各种因素,培养基加倍为最优方式;不同的基因型,在成胚,胚成苗,以及加倍率等都存在差异(P<0.05);在单倍体苗移栽环境上,温室-温室为最优加倍前和加倍后移栽模式。2.有效积温是促进早花亲本No.4512及早花株系开花的直接影响因子,此外,热感应途径是影响春性甘蓝型油菜开花的一条主要途径;开花时间符合正态分布,也有超亲分离现象,开花时间遗传不仅受环境的影响,不同个体之间也存在较大差异,环境与基因型的互作更不能忽略。3.利用SSR标记和AFLP两种分子标记构建了一张包含495个位点总长2252.7 cM的春性甘蓝型油菜遗传图谱,连锁群遗传距离长度范围49.1 cM-201.8 cM;两位点之间平均遗传距离为4.5 cM。4.采用复合区间作图法(CIM)对开花时间QTL进行定位,结果显示:五个环境中共检测到48个QTL与开花时间有关,这些QTL分别位于染色体A2,A3,A5,A6,A7,A10,C2和C8,解释表型变异的3.2~46.5%,其中位于A7的cqDTFA7a和位于C2的cqDTFC2a和cqDTFC2c,在五个环境下可以重复检测到,位于C8的cqDTFC8在四个春性环境下被定位在同一区域,整合分析后发现cqDTFA7,acqDTFC2a和cqDTFC8为三个主效QTL,分别解释表型变异的10.4%,23%和10%,其携带的等位基因表现为负效应,即缩短晚花材料开花天数,属于早花位点。上位性分析发现共八对互作效应对,其中7对表现为(加性×加性)×环境互作效应,这些QTL位于C8,C2,A7,A6,A3和A2染色体。仅有一个QTL,qDTF4,表现的是加×加互作效应,上位性效应最大的是q DTF2×qDTF6和qDTF5×qDTF7,分别解释开花时间表型变异的8.2%和8.3%。发现一个多重上位位点qDTF6(cqDTFC8)位于C8染色体上。上位性效应共同解释表型变异的40.7%,上位与环境的互作效应在四个春性环境中都表现为负效应,而在冬性环境下为正效应。5.通过同源序列法对主效QTL区间进行加密并开发了与主效QTL cqDTFA7a紧密连锁的SSR分子标记GI803,来自白菜型油菜的BACs,KBrB008G18(AC232449),并通过同源克隆确定了这个QTL的候选基因为BnAP1;同样的方法加密并开发了与cqDTFC8紧密连锁的SSR标记S034,来源于甘蓝C8染色体5.5M和5.1M的物理位置;Na12-C12c被定位于qDTFC2c峰值位置;加密了cqDTFC2a区间,将原来的QTL与侧翼标记遗传距离最近12.3cM缩小到目前5.9cM。6.三个位点紧密连锁的标记分别为G1803,S034和Na12-C12在NNDH群体中进行验证,三个标记将DH系分为AA,BB两种类型,我们统计了四个春性环境下的开花时间,AA型花期显著短于BB型花期;复合位点将整个群体分为八个类群(Ⅰ-Ⅷ),同时携带早花等位基因的类群(Ⅰ)花期短于携带晚花等位基因的类群(Ⅷ),并且达到极显著差异(P<0.01),复合等位基因的加性效应直接影响着不同类群DH系的开花天数。为了进一步验证这些标记在育种中的利用价值,进一步利用G1803和Na12-C12在93个甘蓝型育种材料中进行验证,基因型表现为AA的单株平均开花天数显著短于BB基因型的单株平均开花天数(P<0.05),复合位点的效应更加明显。三个紧密连锁的标记可以用于早花基因的辅助选择。
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