本研究在浙江百山祖自然保护区内,设置了66个样地(其中采用标准样方法建立了45个样地,用典型样地调查法建立了21个样地)进行植物群落调查,通过分析群落物种组成和空间结构、alpha多样性、beta多样性和优势种群径级结构等,对整个保护区内的群落类型、分布、结构和物种多样性进行了研究,得到以下结果：(1)66个样地中共记录了维管植物81科、196属、364种,其中蕨类植物9科、12属、14种：裸子植物3科、7属、9种；被子植物69科、177属、341种,其中双子叶植物63科、152属、302种,单子叶植物6科、25属、39种。从种属的丰富度来看,蔷薇科、山茶科、壳斗科和樟科是比较重要的科。(2)根据66个样地的数据,百山祖植物群落可分为针叶林、针阔叶混交林、阔叶林、竹林、灌丛、草丛和草甸7个植被型组、23个群系组、40个群系。(3)详细分析了主要群落类型中优势种群的重要值排名以及部分优势种群的个体径级结构情况。结果显示针叶林中以黄山松、马尾松、杉木和柳杉为主要优势种,针阔叶混交林优势种比针叶林增加了木荷、亮叶水青冈等阔叶树种；阔叶林内以栲属、青冈属和石栎属等树种占优势。各群落中优势种群径级结构主要呈倒“J”形连续分布和偏正态连续分布,中小径级个体在数量上占有优势。(4)对标准样方法调查得到的45个样地数据进行alpha多样性分析,结果显示各植物群落类型乔木层的物种丰富度以常绿阔叶林最高；灌木层以针阔叶混交林的物种数最多,草甸样地的灌木物种数最少；草本层则以竹林物种数最为丰富,常绿落叶阔叶混交林的草本物种最少。乔木层的Shannon-Wiener指数和Simpson指数均为常绿阔叶林最高,其后依次为常绿落叶阔叶混交林、针阔叶混交林、针叶林和竹林。灌木层Shannon-Wiener指数以针阔叶混交林最高,Simpson指数和均匀度指数在各植物群落类型之间差异较小。草本层Shannon-Wiener指数、Simpson指数和均匀度指数均以竹林最高,其Shannon-Wiener指数显著高于针叶林、针阔叶混交林、常绿落叶阔叶混交林和常绿阔叶林,Simpson指数和均匀度指数显著高于针叶林和常绿阔叶林。(5)运用Chao’s群落距离指数计算群落之间的植物群落的差异,并通过Mantel检验、基于距离的RDA分析和方差分解等方法初步检验和衡量了各环境因子差异(包括群落郁闭度、海拔、坡度、坡向和坡位)和群落空间距离对该区域beta多样性格局的影响。该区域内植物群落beta多样性随着群落间综合环境差异或群落空间距离的增加而增大,但环境差异或群落空间距离只能解释36%左右的beta多样性格局。在检验的5个环境因子中,只有群落郁闭度和海拔对百山祖自然保护区植物群落beta多样性有显著影响,并且群落郁闭度对beta多样性的解释度(20%)高于海拔对beta多样性的解释度(18%)。群落空间距离对百山祖自然保护区beta多样性的解释度最小(9%)。