卵磷脂胆固醇酰基转移酶基因单核苷酸多态性与冠心病易感性的关联研究

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冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病,coronary artery disease,CAD)是一种威胁人体健康的重要的疾病,其发病率和死亡率逐年上升。流行病学调查显示冠心病与多种遗传因素有关,尤其是参与脂代谢的多个基因在冠心病的发生发展中起着重要作用,这是因为血脂紊乱是导致冠心病发生发展病理演变的必要前提。在哺乳动物中,卵磷脂胆固醇酰基转移酶(lecithin:cholesterol acyltransferase,LCAT)是胆固醇逆向转运回肝代谢的关键酶,参与维持血浆胆固醇的稳态平衡,调节高密度脂蛋白(high density lipoprotein HDL)等脂蛋白代谢,具有抗动脉粥样硬化功能,是CAD的易感基因之一。 随着人类基因组测序的完成,研究与疾病表型相关的序列变异已成为医学遗传学的一个主要课题。单核苷酸多态(Single-nucleotide polymorphism,SNP)作为第三代遗传标记,具有数量大,分布广的特点。系统地在群体水平上筛查鉴定SNP,特别是编码区和基因调控区的SNP,并通过病例-对照组间的比较和统计学分析,有可能获得与疾病相关联的SNP位点或单倍型。这对于阐明某些复杂的多基因疾病的遗传机理具有重要意义。 本课题通过对中国汉族以D患者和正常个体中LCAT基因已知cSNP的研究和未知cSNP的筛选,比较这些cSNP在患者和正常对照人群中的分布,揭示LCAT基因cSNP与脂代谢紊乱及冠心病的关系,以期阐明其在CAD发生发展中的作用。 首先,我们采用聚合酶链反应一限制性片断长度多态性 (pol卿erase ehain reaetion一restrietion fra脚ent lengthpolymorphism,PCR一RFLP)方法研究了我国正常人和CAD患者中3个已知eSNp位点(6o8C>T,91 IT>C和1188C>T)的分布频率,并初步探讨它们与脂代谢和冠心病的关系:其次,运用DHPLC技术筛查忧AT基因外显子区域未知的csNP,进一步通过测序和PCR一RFLP方法验证后,对这些cSNP与脂代谢和以D的相关性进行了统计学分析。 对3个己知cSNP位点的研究结果显示,在中国人群中仅存在6OSC>T多态位点。在对照组中,两种等位基因的频率分别为97.13% (608C)和2.87%(608T),而在CAD患者组中为99.26%(608C)和0.7钱(608T),等位基因频率分布符合Hardy哪einberg平衡。经卡方检验,该位点等位基因(尸=0.034)和基因型频率(尸二0.032)分布在对照组和患者组间差异显著,以D组6OST频率显著低于对照组,提示L以T基因的608C>T多态位点可能与以D相关。从患者组血脂水平的变化来看,有6OST的HDL{水平显著高于无608T的患者(尸二0.015),表明608T等位基因与以D患者较高的血浆HD卜C水平相关联。 运用PCR一DHPLC、DNA测序和RFLP方法发现了1个新的cSNP,即位于第四外显子的5llC>T(P 143L),在190例以D患者中共检出了n个杂合子,但未见纯合子。在患者组中的基因型和等位基因频率分别为5.79%和2.89%,等位基因频率分布符合Hardy--Weinberg平衡。与此同时,在209例对照中没有检出上述多态。进一步将患者组按HD卜C水平正常与否分为HDL代谢紊乱亚组(LHDL,1。,HDL{level,表现为HDL一C降低)和HDL代谢正常亚组(NHDL,normal HDL一level)。经卡方检验,患者组中该位点等位基因及基因型频率不仅在LHDL和NHDL两亚组组间,并且在两亚组的男性间有显著性差异,而且通过logister线性回归分析,5llT在以D两亚组和两亚组男性间与HDL代谢紊乱有着显著性相关,其odds一Ratios(ORs)[9溅可信区间〕分别为5.754[1.893一13.785]和7.003[2.243一21.859〕。表明5llC>T(P143L)这一新的多态位点与CAD患者中HDL代谢紊乱显著相关。 除此之外,我们还发现了3个新的cSNP,即位于第一外显子的52T>A(L一1 IQ)、第六外显子的1230A>G(5383G)和1278C)T(R399C)。其中1230A>G(5383G)等位基因(尸=0.061)和基因型频率(尸二0.058)经卡方检验在正常对照组和以D患者组间差异不显著,因此该位点与脂代谢紊乱及以D可能无明显相关性。其余两个位点频率小于1%,故未作进一步的讨论。
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