本文结合医药流通企业的特点和同济堂配送中心的运行实际，在供应链战略合作的基础上，以供应链管理、物流管理、采购与供应管理等管理思想为理论支撑，利用战略合作伙伴关系论、系统论和博弈论等建立分析模型，结合当今供应链和物流的发展趋势，以定量与定性相结合的方法，采用统计资料分析、实地考察、对比的研究等手段对供应链战略合作伙伴关系进行较为深入的研究。文章阐述了在当今激烈市场竞争的环境下同济堂公司实施战略合作的必要性；介绍了同济堂公司实施客户关系管理和供应商关系管理实施的基本思路及应用。实践证明，同济堂配送中心将下游连锁网络终端、上游的药品生产商连成一个整体，通过POS系统配送中心管理各药店的库存，而配送中心的库存又通过VMI由供应商来管理，取得了增加收入、减低成本、实现科学的决策以提升管理水平等一系列成效。