为了研究藻蓝蛋白β亚基Cys-84裂合酶CpeS结构与功能的关系，通过相似性蛋白的搜索和同源性序列比较，找到了CpeS中与其它相似性蛋白同源性较高的保守性氨基酸位点。选取了四个色氨酸保守性位点，分别进行定点突变，构建了CpeS的四个色氨酸突变体，分别为CpeS(W14I)、CpeS(W69M)、CpeS(W75S)和CpeS(G119C,W140V)。然后通过体内重组检测裂合酶活性的变化，研究色氨酸残基的突变对裂合酶催化活性的影响。重组结果显示：突变体CpeS(W14I)的催化活性几乎完全丧失，为野生型的7％；突变体CpeS(W69M)的催化活性为野生型的47％；突变体CpeS(W75S)的催化活性为野生型的76％；突变体CpeS(G119C,W140V)的催化活性为野生型的68％。由此推测，第14位色氨酸可能是CpeS酶活性的必需氨基酸，其所处的位置可能是裂合酶CpeS的活性位点。该结果为研究裂合酶CpeS色氨酸残基的功能提供了相关信息，对于进一步研究该酶结构与功能具有重要意义。在构建突变体的Megaprimer PCR过程中发现，Taq DNA 聚合酶具有末端转移酶活性，在PCR过程中容易在产物的3’端引入一个不能与模板相匹配的dA残基, 引发非预期的突变。因而在设计突变引物时要设法避免这种非预期突变的发生；如果选用保真度高的Pfu DNA聚合酶进行PCR也可以避免这种情况的发生。