酵母基因组中功能调控网络及其转录调控动力学机理研究

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基因转录调控网络是生命功能在基因表达层面上的展现.在过去几年,包括基因组范围表达分析和定位分析等一些技术和方法的发展和使用,使人们对于调节酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)基因表达的转录调控网络的了解有了新的进展,积累了大批有关基因表达的实验数据.该文使用布尔网络模型分析了细胞周期过程中的全基因组表达数据,从三个不同的实验数据集中匹配出3620个基因,它们分别具有周期4或周期8的表达模式,并且对不同初始时相表现出鲁棒性.对基因组范围定位数据,分析106个转录因子的动力学轨迹,并找到它们所负责调控的周期基因.将这些周期基因和转录子应用到细胞周期、呼吸链和ATP合成系统、泛素化和蛋白质降解系统、PKC和Ras proteins磷酸化级联通路以及转录调控系统这五种活细胞生命活动过程,找出六种典型基因功能调控网络,同时搜索各个网络中每个结点的周期基因的可能保守序列,发现一些有生物学意义的结论.
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