光腔中囚禁离子系统在量子计算和量子通信等领域有着广泛的应用前景,囚禁离子与光场相互作用的研究备受关注;量子纠缠是操控、存储和传递量子信息的基本资源,所以纠缠态的制备、纠缠的度量以及纠缠的传递一直是量子光学和量子信息科学的热门课题。本文研究了囚禁在光腔中二能级原子的发射谱及其动力学行为,考察了两个二能级原子分别与双模光场的一个模相互作用的系统中原子间纠缠和腔场模间纠缠的演化规律。首先,我们研究了理想腔中单模行波光场驱动的囚禁二能级原子的发射谱及其动力学行为,给出了不同调谐参数下系统的等效哈密顿量,推导了原子发射谱的一般表达式和系统的演化态矢。我们的研究结果表明囚禁原子的发射谱和动力学行为不仅依赖于系统的初态,还与调谐参数和Lamb-Dicke参数密切相关。选择适当的条件,系统既可演化到原子内态、原子质心运动和腔场的最大三体纠缠纯态-GHZ态,也可演化到原子内态和腔场（原子质心运动）的最大两体纠缠纯态-Bell态。其次,我们研究了在Lamb-Dicke参数较小情况下单模驻波光场驱动的俘获二能级原子发射谱,讨论了原子质心运动对原子发射谱的影响。当原子质心运动与光场无关联时,原子质心运动的存在不影响原子发射谱对光场和原子偶极矩相对相位的敏感性,随着原子质心运动平均能量的增强,原子发射谱峰间的相对距离减小,峰高的变化与原子质心运动和光场所处的状态有关。当原子质心运动与光场有关联时,原子发射谱失去其相位敏感性,在适当条件下原子发射谱峰的数目减少,峰高增大,峰宽变小。我们还利用negativity和concurrence两种纠缠度度量标准,考察了双原子与双模光场相互作用系统中,原子间纠缠和光场模间纠缠随时间的演化规律,发现在原子和光场相互作用过程中二者可以相互转换,在一定条件下二者还具有很好的对应关系;通过比较negativity和concurrence这两种度量标准,发现二者在判断纠缠存在与否的标准上是完全相同的,而在纠缠度大小的度量标准上不能始终保持一致。最后,我们研究了原子间偶极-偶极相互作用对原子和腔场间纠缠传递的影响,弱偶极相互作用不仅可以诱导原子间纠缠,而且几乎不影响原子和腔场间的纠缠传递;强偶极相互作用亦可诱导原子间纠缠,并可使原子初始时刻具有的纠缠保持下来,却使原子很难将其纠缠传递给光场。