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目的：先天性甲状腺功能减低症是儿科常见内分泌疾病,分析苏州新生儿疾病筛查中心(简称新筛中心)1999年至2013年新生儿先天性甲状腺功能减低症(Congenital hypothyroidism,CH)的发病情况.通过调查分析所筛查地区(五县五区)1999年至2013年新生儿先天性甲状腺功能减低症的发病及转归情况,寻找相关发病因素,为今后苏州地区CH的预防和治疗提供指导、为对CH的进一步研究提供数据资料。方法：用回顾性调查的方法对苏州新筛中心1999-2013年内的794851例新生儿疾病筛查相关报表和病案信息资料分析进行描述性分析和统计推断。调查和检测方法：采用时间分辨荧光免疫分析法(TRFIA)检测新生儿的血清中促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone, TSH)值,对TSH值异常患儿进行召回取静脉血,采用化学发光法检测血清中三碘甲状腺素(T3)、甲状腺激素(T4) 、游离三碘甲状腺原氨酸(FT3)、游离甲状腺素(FT4)、TSH和甲状腺球蛋白(TG)浓度；凡血清TSH增高大于5.5 uIU/ml/、FT4低于12pmol/l为CH患儿。对治疗后的CH患儿进行描述性、回顾性分析,寻找其发病影响因素,探讨治疗效果,并应用SPSS 17.0软件进行统计分析。随机选取首次产检(孕3月)甲状腺功能结果齐全的且已分娩确诊为CH患儿的孕妇86例作为病例组,随机选取同时期相同孕期甲状腺功能结果齐全的且已分娩正常新生儿的孕妇200例作为对照组,对两组孕妇首次产检(孕3月)的TSH和抗甲状腺过氧化物酶抗体([POAb)结果进行统计分析。结果：1.苏州新筛中心1999年-2013年进行新生儿先天性甲状腺功能减低症筛查的794851例新生儿中,确诊为先天性甲状腺功能减低症的患儿461例。CH的发病率1：1724(5.8/104)。与全国CH发病率1：2047(4.9/104)相比,略高于全国。2.男婴207例,发病率1：2040(4.9/104)。女婴254例,发病率1/1467(6.8/104)。男女婴发病率之比为1：1.39,男婴低于女婴(P<0.01)。3.所筛查地区各县区发病率进行比较,苏州工业园的发病率高于其他区县,(P<0.05)。4.从2001年至2010年CH的发病率出现逐渐升高趋势,至2010年达高峰,2011-2013年发病率趋于稳定。运用统计软件分析,CH的发病率有明显的季节相关性,夏秋季低于冬春季(P<0.05)。母亲妊娠TSH及TPOAb异常与其分娩新生儿患CH有一定关系。5.随访满2年的患儿393例,暂时性CH与永久性CH之比为138：255(35.1%)。男婴暂时性CH占男婴CH总数74/186(39.9%),女婴暂时性CH占女婴CH总数64/207(30.9%),男女有统计学差异(P<0.01)。6.随访满2年患儿中,甲状腺发育异常占CH患儿76：393(19.3%)。暂时性CH中无一例甲状腺发育异常；永久性CH中255例中甲状腺发育异常76例,占76/255(29.8%)。永久性CH患儿伴有其他系统畸形者30例,占永久性CH的30/255(11.8%)；暂时性CH低伴有其他系统畸形者2例,占暂时性CH的2/138(1.4%)。永久性CH中先天性畸形的发生率比暂时性CH增高,有统计学差异(P<0.01)。7.永久性CH患儿确诊时平均TSH水平高于暂时性CH患儿,经ROC曲线分析,TSH>43.4 uIU/ml时诊断为永久性CH可能性大,特异性为84.8%,敏感性77.3%；TG显著降低及显著升高对判断先天性甲状腺功能减低症转归有一定意义。结论：1.苏州新筛中心的CH发病率1：1724,与全国CH发病率1：2047相比,高于全国。2.苏州新筛中心CH的发病率2001年至2010年逐年上升,2010年发病率最高。2011年至2013年有所下降并逐渐平稳。3.苏州新筛地区中五区五县的发病率苏州工业园区发病率最高。4.男婴的发病率低于女性。6. TSH>43.4 uIU/ml时先天性甲状腺功能减低症转归为永久性甲状腺功能减低症可能性大。TG显著降低及显著升高成为永久性CH可能性大。