新城疫病毒新型可视化RPA-LFD检测方法建立与初步应用

来源 :华南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:catva
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
新城疫(Newcastle Disease,ND)是由新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)引起的一种急性、烈性、高度接触性禽类传染病。ND发病的主要特点为呼吸困难、拉稀、神经机能紊乱、粘膜和浆膜出血坏死,具有较高死亡率,对禽类生产造成严重的危害。因此,建立一种简单、快速、准确的NDV检测方法对ND防控以及养禽业的发展具有非常重要的意义。重组酶聚合酶等温扩增技术(Recombinase Ploymerase Amplication,RPA)是一种新型核酸等温扩增技术,具有操作简单、特异性高、敏感性强和不依赖复杂仪器的优点,同时扩增产物易形成气溶胶造成假阳性污染。而全封闭式横向流动试纸条技术(lateral flow dipstick,LFD)是将核酸试纸条置于方便携带的密闭装置中,可避免核酸产物外泄造成的假阳性污染。本研究将RPA技术与LFD技术相结合,通过对反应条件的优化,建立了一种针对NDV的RPA-LFD快速检测方法,对该方法的特异性、敏感性进行了研究和分析,并将该方法进行临床初步应用。研究结果如下:1.NDV RPA-LFD检测方法的建立:本研究根据RPA引物设计原则,针对NDV F基因保守区域设计3对引物,以NDV F48E9株的cDNA为模板,将引物两两组合分别进行RPA反应,通过凝胶电泳检测方法对引物进行筛选并建立RPA凝胶电泳反应体系。再按照nof探针设计原则,选择一条最佳引物作为RPA-nof探针,建立NDV RPA-LFD反应体系。为了确定该检测方法的最适反应条件,我们设计了不同的反应温度、时间、引物和探针的终浓度,对NDV RPA-LFD检测方法反应条件进行优化。综合优化结果,我们选择37℃作为该检测方法反应温度,20 min为该检测方法的反应时间,420 nM、120 nM分别为该检测方法的引物和探针的终浓度。我们以NDV的F48E9株、GM株、Lasota株的cDNA为模板,按照已经确定的优化条件,分别进行RPA-LFD反应,并以ddH2O为空白对照。结果显示,NDV 3种毒株LFD检测装置内检测线和质控线都有两条红色条带,而ddH2O仅在质控线出现一条红色条带,即NDV 3种毒株检测结果均为阳性,表明本研究成功建立了NDV RPA-LFD检测方法,且具有较广的适用性。2.NDV RPA-LFD检测方法特异性、敏感性的研究:将所建立的NDV RPA-LFD检测方法对NDV、禽流感病毒(Avian Influenza virus,AIV)、鸡传染性法氏囊病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)、马立克氏病毒(Marek’s disease virus,MDV)、鸡传染性支气管炎病毒(Infectious bronchitis virus,IBV)、沙门氏菌、大肠杆菌其它相关病原进行检测。结果显示,NDV LFD检测装置内检测线和质控线都有两条红色条带,而其它相关病原仅在质控线出现一条红色条带,即该方法对NDV检测结果为阳性,其它相关病原检测结果为阴性,表明NDV RPA-LFD检测方法具有良好的特异性。我们进一步将NDV RPA-LFD检测方法与常规PCR琼脂糖凝胶电泳法、RPA琼脂糖凝胶电泳法进行敏感性比较。结果显示,常规PCR琼脂糖凝胶电泳法、RPA琼脂糖凝胶电泳法、RPA-LFD检测方法可以检测到NDV重组质粒最低检测浓度分别4.46×104 copies/μL、4.46×103 copies/μL、4.46×103 copies/μL;可以检测到NDV的cDNA最低含量分别为66.7 pg、66.7 pg、6.67 pg,表明NDV RPA-LFD检测方法比常规PCR琼脂糖凝胶电泳法更具敏感性。3.NDV RPA-LFD检测方法临床样品的应用:采集23份疑似ND病料,用RPA-LFD方法和常规PCR琼脂糖凝胶电泳法进行检测。结果表明,NDV RPA-LFD方法检出12份阳性,常规PCR扩增后经1%琼脂糖凝胶电泳检出14份阳性,NDV RPA-LFD检测方法与常规PCR琼脂糖凝胶电泳法检测临床病料的阳性符合率为85.7%,表明NDV RPA-LFD检测方法在临床应用上是可行的。综上,本研究通过反应条件的优化,建立了一种NDV RPA-LFD快速检测方法,并对该方法的特异性、敏感性进行研究,临床初步应用进行分析。结果表明,NDV RPA-LFD检测方法具有操作简单、费时少、不需昂贵仪器,结果准确、可视化等优点,适合NDV基层临床检测。
其他文献
目前,估价业界虽然对抵押估价的价值类型统一认识为是抵押价值类型,不属于市场价值类型,但大部分估价人员在认识上仅停留在抵押价值需要扣减法定优先受偿款,而仍然将评估未设
对于坡比1:3坡面的护坡现浇砼施工,采用砼搅拌车结合溜槽进行施工,取得较好的经济效益,工期得到保证,通过基面处理、模板制定、砼振捣、砼面收光及压光、砼养护等关键工序的认真操
基于题组反思式教学在高中生物复习中的作用,本文就五点进行分析:应用题组反思式教学,强化学生对概念的理解;发现生物解题规律,提高解题能力;突破教学重点,提高复习质量;强化
Q:提问张辰总工、邹惠君副总:昨天谢院长提到堤外洪水和堤内降雨是两个独立时间,那排涝泵站是否在外江最高洪水位下,也应该能够按照设计流量排出?关于这一问题《室外排水设计规
让学生亲自参与班级管理,可以培养他们的主人翁意识,可以使班级朝着和谐、团结、向上的目标发展。文章结合班主任班级管理经验,从共同制定班级目标、建立班级“联合国”、组
将批处理机调度问题扩展到分布式环境下,提出了批调度问题的一个新模型.模型中,工件动态到达各批处理机,且在加工之前和之后需要有运输时间.证明了该模型是NP难的,并通过问题的一个
该研究选取两所美国一流公私立大学--伯克利加州大学和哈佛大学,采用文本分析法、案例研究法与比较分析法对两校教师绩效评价制度进行比较,发现目前美国一流大学教师绩效评价
目的:观察活血化瘀法治疗糖尿病周围神经病变的临床疗效,探讨其作用机理。方法:将65例患者随机分为两组。治疗组34例用通心络胶囊治疗,对照组31例用维生素B1100mg、维生素B12 250
硒具有重要的生理保健功能,对许多疾病具有预防或治疗作用。如:爱滋病、癌症、心血管疾病、克山病与大骨节病及提高机体免疫机能等。硒的生物功能中以其抗氧化性最为显著,可有效
在祖国医学完整的医疗体系中,中医耳鼻咽喉科学是一个重要的分支学科.随着祖国医学的不断发展,学科分类亦日趋完善,中医耳鼻咽喉科学的许多理论、疾病,已由过去的与内科、外