【摘 要】
：
油菜是世界上最重要的油料作物之一,对油菜含油量及菜籽油品质的遗传改良研究具有现实意义。农作物很多农艺性状都属数量性状（Quantiative Trait Loci,QTL）,数量性状受多基因调控且易受环境的影响。数量性状位点定位（QTL Mapping）是研究数量性状的经典方法,本研究在课题组前期构建的一张以SNP为主要标记的高密度遗传连锁图的基础上,以KN DH群体（父本为低芥酸高硫苷含量的春性
【基金项目】
：
国家基础研究计划项目的资助（No.2015CB150205）
论文部分内容阅读
油菜是世界上最重要的油料作物之一,对油菜含油量及菜籽油品质的遗传改良研究具有现实意义。农作物很多农艺性状都属数量性状（Quantiative Trait Loci,QTL）,数量性状受多基因调控且易受环境的影响。数量性状位点定位（QTL Mapping）是研究数量性状的经典方法,本研究在课题组前期构建的一张以SNP为主要标记的高密度遗传连锁图的基础上,以KN DH群体（父本为低芥酸高硫苷含量的春性品种“Ken-C8”,母本为高芥酸低硫苷含量的冬性品种“N53-2”,两者含油量相差约10%）为研究对象,对多年份多地点种植的甘蓝型油菜脂肪酸组分性状进行QTL定位,获得了环境稳定、环境特异及一些新的脂肪酸组分QTL位点,为分子标记辅助育种提供了直接的帮助。通过比较基因组学分析,在所定位到的QTL置信区间中筛选和脂肪酸代谢相关的候选基因,并在整体水平上探讨了甘蓝型油菜脂肪酸的代谢过程。本研究主要工作内容如下:（1）脂肪酸组分表型测定及相关性分析。油酸（C18:1,oleic acid,OA）、亚油酸（C18:2,linoleic acid,LA）和芥酸（C22:1,erucic acid,EA）3个组分含量最丰富,平均值分别34.05%、15.53%和26.48%。C18:1、二十碳烯酸（C20:1,eicosenoic acid,EIA）和C22:1的含量在群体分布上表现出明显的双峰分布模式,棕榈酸（C16:0,palmitic acid,PA）、硬脂酸（C18:0,stearic acid,SA）、C18:2、亚麻酸（C18:3,linolenic acid,ALA）和饱和脂肪酸（FAS）4个组分在群体中表现为正态或近正态分布规律。含量相关性分析结果显示,C20:1和C22:1高度正相关,这2个组分与其他6个组分负相关,而这6个组分之间表现为正相关。（2）脂肪酸组分73个非条件性环境稳定QTLs、22个环境特异QTLs和25个新的QTLs定位。总共定位到406个非条件性identified QTLs,单个QTL能够解释的最大表型方差（Phynotypic variance,PV）为45.05%。406 identified QTLs被进一步整合为204个非条件性consensus QTLs,其中包含81个为主效QTLs,74个环境稳定表达QTLs和22个环境特异表达QTLs。这些consensus QTLs进一步被整合为127个多效的非条件性unique QTLs,单个unique QTL能够解释的最大PV为45.05%。与之前的研究相比,总共定位到了脂肪酸组分的25个新的QTLs。（3）获得69对上位性互作对、2081个条件性identified QTLs和1667个条件性consensus QTLs。总共检测到69对加性Χ加性（AdditiveΧAdditive,AΧA）型的非条件性QTL上位性互作对,其中71%位于A8和C3连锁群上。总共检测到2081个条件性identified QTLs,这些QTL解释的PV范围为1.32%-39.75%,PV平均值较非条件的17.99%降到了条件下的7.59%。2081个条件性identified QTLs被进一步整合为1667个条件性consensus QTLs。（4）7802个候选基因的筛选和富集互作分析及脂肪酸代谢途径构建。在127个非条件性unique QTLs置信区间中筛选到7802个拟南芥同源候选基因,这些候选基因对应13599个油菜基因,只和酰脂代谢相关的候选基因有278个。7802个候选基因中的7787个参与GO富集分析,1547个候选基因被富集到了16条属于KEGG的路径当中。同时对总候选基因进行了互作分析。为更加直观了解候选基因怎样参与酰脂代谢过程,构建了甘蓝型油菜脂肪酸代谢网络,该代谢网络包括了质体脂肪酸合成、脂肪酸延伸、TAG合成和降解、磷脂和硫脂合成、β氧化、脂质转运以及油体的形成等途径。综上所述,本研究对甘蓝型油菜脂肪酸组分性状进行了条件和非条件性QTL定位,得到了大量条件和非条件性QTLs,同时获得了能够在多个环境中稳定表达的QTLs、环境特异性表达的QTLs和一些新的QTLs位点。QTL的上位性分析展示了脂肪酸组分的遗传复杂性,候选基因的筛选及富集和互作分析从基因组层面进一步揭示了脂肪酸复杂代谢的过程。网络途径的构建从整体上更加清晰地展示了脂肪酸代谢的分子机制。以上研究结果为甘蓝型油菜脂肪酸组分QTL的精细定位及分子辅助育种工作提供了帮助,也为植物脂肪酸代谢研究提供了更多的理论基础。
其他文献
随着可穿戴电子、智能电子以及交互式电子产品的迅速发展及其应用场景的扩展,锂离子混合电容器、准固态柔性电容器、透明电容器以及耐低温电容器等功能化超级电容器受到了广泛的关注。相比于双电层碳材料,过渡金属氧化物通常具有更高的比电容,因而被广泛应用于各种功能化超级电容器中。然而,受限于过渡金属氧化物内部缓慢的电荷传输动力学,器件的功率和能量特性通常发挥不佳。特别是在兼顾各种功能化特性的情况下,材料、电极和
【目的】本研究目的是构建兵团区域医联体医养结合服务评价工具,通过实证评价,确定服务提供相关经验与薄弱环节的相关证据,探究服务供需匹配对服务效果的影响机制,有针对性的提出兵团区域医联体医养结合服务优化策略。【方法】（1）通过文献研究法和内容分析法,构建区域医联体医养结合服务的理论模型,采用系统综述法、专家咨询法和层次分析法构建兵团区域医联体医养结合服务评价工具。（2）数据收集:1)采用典型抽样的方法
癌症作为导致人类死亡的主要恶性疾病之一,目前其治疗手段主要包括外科手术、放射治疗、化学药物疗法以及它们的联合应用,这些方法虽然具有很好的疗效,但往往会对机体造成不同程度的损伤。近年来,肿瘤免疫治疗由于对癌症种类的广谱性、治疗时间的持久性和副作用小等优势而受到广泛关注。传统的蒽环类抗癌化疗药物可以通过免疫原性细胞死亡（immunogenic cell death,ICD）机制激活体内的抗肿瘤免疫应答
党的十九大以来,慈善组织在参与社会治理、构建基层治理新格局中的作用愈发重要,国家甚至赋予慈善组织承担“第三次分配”功能。慈善组织参与社会治理绩效成为广受关注的热点问题,其中政治关联现象是影响慈善组织绩效的重要因素之一。政治关联是慈善组织领域普遍存在的社会现象,政治关联研究在企业管理领域较为成熟,然而慈善组织政治关联研究较少,虽个别文献有所涉及,但研究的广度和深度还有较大提升空间。慈善组织政治关联对
摘要目的低剂量CT（LDCT）对肾结石和静脉石的鉴别诊断对于急性腰痛病人治疗方案的制定具有重要意义,但LDCT鉴别两者存在一定困难。本研究旨在探讨基于LDCT
第一部分TSHR在正常组织和分化型甲状腺癌（DTC）中的表达评估目的:近年来,嵌合抗原受体（Chimeric antigen receptor,CAR）修饰的T细胞（CAR-T）治疗在血液系统恶性肿瘤中的成功应用,彻底颠覆了传统的肿瘤免疫治疗模式。然而,该疗法在实体瘤中却进展缓慢,其中最主要的原因是缺乏合适的肿瘤特异性抗原（Tumor specific antigen,TSA）作为治疗的靶点。将C
第一部分唯支持细胞综合征致病基因突变的筛查【目的】目前大部分SCOS患者的病因未知,但极有可能还是遗传因素;明确SCOS的病因是发展和完善其诊断体系的重要方面。本研究利用全外显子测序（Whole exome sequencing,WES）,对病因未知的唯支持细胞综合征（Sertoli cell-only syndrome,SCOS）患者的致病基因突变进行筛查。【方法】对一例父母为近亲结婚的男性不育
目的:急性肾损伤（Acute kidney injury,AKI）每年导致170万患者死亡,其发病率还在逐年升高。临床上主要使用肾脏替代疗法治疗AKI,且目前没有针对AKI的有效药物应用于临床,因此迫切需要相关研究以改善临床AKI治疗的困境。Elabela（ELA）是血管紧张素受体样蛋白J受体（Angiotensin receptor-like protein J receptor,APJ）的天然
经肝动脉化疗栓塞（Transcather Arterial Chemo-Embolization,TACE）是目前治疗不可切除中晚期肝癌的一线临床疗法,栓塞剂在其中起到重要的作用。然而当前栓塞剂普遍存在“流动性-栓塞性困境”。例如,基于碘油的经典化疗栓塞（C-TACE）是目前评价栓塞治疗效果的“金标准”。尽管碘油具有良好的流动性,可弥散到肝癌末梢血管网,但其栓塞强度低,导致血供复通。为了解决这一问
目的:AT丰富结构域1A（ARID1A）基因染色质重塑复合物SWI/SNF最重要的亚基之一,也是胃癌中最常见的突变基因之一。然而针对ARID1A基因在肿瘤发生的初始阶段中的研究甚少,包括TCGA在内的各大数据库中40岁以下的早发胃癌（EOGC）病例数屈指可数。因此,迫切需要系统性探究ARID1A在EOGC这一独特的临床模型中的遗传变异和蛋白变化以揭示ARID1A的未知作用。方法:采用深度靶向高通量