河流在元素地球化学循环中起着重要作用，是全球水循环的重要组成部分。其水化学特征在反映当地地质、地理、气象和生态的同时，还反映了地表风化侵蚀作用、人类活动对河流生态环境的影响状况。在塔里木河流域河水化学相关研究的前提下，为了更好的保护塔里木河流域的社会环境，评价11年的生态输水作用下的塔里木河下游河水化学特征，我们对河流的水化学特征进行了全面系统的检测研究，并根据水化学原理从人类活动、风化等几点分析了塔里木河下游河水主要离子的来源。通过研究得出，总体上，塔河下游河水各阳离子百分含量大小循序为Na⁺＞Ca²⁺＞Mg²⁺＞K⁺；各阴离子百分含量大小循序为Cl^-＞SO₄^2-＞HCO₃^-。空间上，由于SO₄^2-和K⁺+Na⁺的含量的变化导致一些地区离子主成分含量大小顺序的变化。夏季塔河下游河水中各离子浓度比其他时间高。沿流程呈逐渐上升的趋势，从库尔干开始各离子含量出现迅速增加；水化学类型以氯化物类水为主，8月份的河水以硫酸类水具多。塔河下游河水呈现弱碱性，最低值出现在冬季输水期间，最高值出现在夏季输水停止后。各时期矿化度大小顺序基本呈现为：夏季输水后期＞夏季输水前期＞冬季输水后期＞冬季输水前期。从大西海子水库到尾闾台特玛湖，河水从淡水变到盐水，台特玛湖有些地方还出现卤水。河水属于软水～极硬水；河水主要离子来源分析得出，人类活动对Cl^-、SO₄^2-离子浓度的影响不大，其主要来源为可溶型盐的溶解。HCO₃^-主要来源为碳酸盐的风化分解。通过化学风化对水化学的影响分析，塔河下游流域Ca²⁺、Mg²⁺离子主要来自碳酸盐的影响，硅酸盐类的风化分解和蒸发盐岩的分解也有较大的影响。Na⁺主要来源于硅酸盐分解和蒸发。盐岩溶解也是K⁺离子的重要来源。2011年的塔河下游水化学组成与输水刚开始时的比较结果表明，阴阳离子主次循序没发生变化，各离子浓度的变化范围比2000年的大；由于塔里木河下游本身就具有丰富的盐分含量，生态输水只在形式上淡化了各离子浓度，没能减少盐分的总量，只有通过全流域综合治理，并增加下游来水量，严禁上中游灌区排水注入干流，严格控制下游河水中各离子量在适当的浓度范围内，才能有效的恢复下游的生态系统。