配伍是方剂学的核心理论，也是研究方剂的关键问题，探求方剂的配伍规律对于在更高层次上认识方剂的配伍方法、指导临床用药具有十分重要的理论及实际意义。本研究从文献角度入手，从方剂配伍的定义、理论渊源以及配伍研究的内容、方法等多方面总结了方剂配伍研究的现状。同时，建立在肾气丸补骨生髓的基础上，以数理模型为指导，对肾气丸防治维A酸所致大鼠骨质疏松的作用进行配伍研究(肾气丸拆成六味地黄汤组和桂附组)。 2×2析因实验设计分析肾气丸对骨密度(BMD)影响结果表明：六味对骨密度影响的统计意义显著(P=0.0001)，桂附的意义不显著(P=0.0548)，二者的交互作用有统计学意义(P＜0.05)，说明六味与桂附在对维甲酸所致骨质疏松大鼠的骨密度影响方面有协同作用，即桂附对六味提高骨密度方面有促进作用。此外，血清生化指标、生物力学、形态计量学、免疫组化等多方面结果显示：肾气组均优于六味及桂附组(P＜0.05或P＜0.01)。 上述结果表明：①肾气丸对维A酸所致大鼠骨质疏松具有明显的抑制作用，可使骨密度明显增加；②通过析因实验证明桂附与六味合用，即肾气丸在提高骨密度方面，两者体现的是协同的配伍关系；③肾气丸是通过作用于成骨与破骨细胞、调节激素与细胞因子水平来提高维A酸所致骨质疏松大鼠的骨密度的；④无论从《金匮要略》原文证候分析，还是从肾气丸的药物组成分析，以及从肾气丸的衍变分析，肾气丸的功效为温补肾气更为准确。