基于T7启动子的原核增强子样序列筛选及其功能区域研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cangxialong
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
增强子(enhancer)是包含转录因子结合位点的顺式作用元件,对靶基因表达具有激活作用,但目前其分子作用机制并不清楚。人们发现在原核生物的基因组和某些病毒基因组的一些DNA片段中具有增强子样功能。研究表明原核增强子样序列可作为原核表达系统改进的一种工具。T7启动子表达系统是原核表达的首选,对多数小分子量基因能较好表达,但较大外源基因效果不好,而目前通过原核增强子样序列对促进分子量相对较大外源基因表达研究不多。从微生物基因组中寻找新的原核增强子样序列不仅对改善原核表达系统有一定的实用价值,而且为原核增强子样序列的调控理论研究奠定基础。本研究工作包括4个部分:(1)增强样序列检测载体的构建;(2)含增强子样序列菌株的筛选及其载体鉴定;(3)含增强子样序列菌株报告基因表达检测及序列分析;(4)增强子样序列的功能区域研究。(1)增强子样序列检测载体构建本研究以人乳头瘤病毒(Human Papilloma Virus, HPV)主要衣壳蛋白基因L1(或L1截短序列L11)与氯霉素乙酰转移酶基因(chloramphenicol acetyltransferase, CAT)连接为融合报告基因,构建了两种分子量大小不同增强子样序列检测载体。将L1-pMD18-T/DH5α和CAT-pET21a/DH5α菌株质粒抽提,酶切连接构建增强子样序列检测载体Ll-CAT-pET21A;之后,通过PCR扩增得到L1的截短序列L11,并重组到CAT-pET21a,构建检测载体L11-CAT-pET21A。经酶切鉴定与测序结果表明两个重组载体构建正确。为后面可进行筛选研究,首先对检测菌株进行了功能测试。将两重组质粒转化到E.coli BL21(DE3),测定其氯霉素生长浓度皆为34μg/mL,且报告基因L1-CAT在L1-CAT-pET21a/BL21重组菌株蛋白表达没有明显条带,而在L1-CAT-pET21a/BL21中报告基因L11-CAT目的蛋白有明显条带。(2)含增强子样序列菌株的筛选及其载体鉴定采集污水或土壤,样品加入培养基中,富集培养混合菌,抽提基因组DNA,确定Sau3A I酶切基因组的最佳条件。将基因组DNA酶切片段插入两种检测载体,构建多个基因文库。经氯霉素初步筛选发现3株重组菌株:其中ER1-L1-CAT-pET21a/BL21和ER2-L1-CAT-pET21a/BL21重组菌氯霉素抗性提高至检测菌株的5倍;而ER3-L11-CAT-pET21a/BL21重组菌氯霉素抗性提高至检测菌株的11倍。酶切鉴定及测序结果表明:ERl-L1-CAT-pET21a和ER2-L1-CAT-pET21a含有插入序列,但检测载体骨架部分发生缺失突变;而另一载体ER3-L11-CAT-pET21a有插入序列,且检测载体骨架没有缺失突变。(3)含增强子样序列菌株报告基因表达检测及序列分析将筛选获得重组菌株经IPTG诱导表达,通过SDS-PAGE检测,结果发现:ER3-L11-CAT-pET21 a/BL21诱导L11-CAT融合蛋白表达,该菌株的融合报告基因蛋白表达提高至检测菌株的2.26倍;而另外两株重组菌株ER1-L1-CAT-pET21a/BL21和ER2-L1-CAT-pET21 a/BL21诱导表达,在85kDa处没有明显条带,但在45-66.2kDa之间有明显条带,这与载体鉴定中发现重组载体缺失突变的结果相符。将ER1序列和ER2序列重新构建到L11-pET21a,结果两条序列分别使L11蛋白表达提高到L11-pET21a/BL21菌株的1.78倍和1.37倍。在NCBI的数据库中,序列分析表明:1)ERl没有同源性较高的相似序列,其序列的229,-4.11bp与多种原核生物的同源性高达90%,序列412-517bp与嗜水气单胞菌同源性达到77%;2)ER2与嗜水气单胞菌的基因同源性达到100%;3)与ER3同源性最高的是蜡状芽孢杆菌,达到71%。此外,转录结合位点的预测显示这些序列都有多个转录因子结合位点,可与多种转录因子结合:同时保守区域的推测表明:ER1有两个保守区域,而ER3有一个保守区域。(4)增强子样序列的功能区域研究为确定增强子样序列ER1和ER3的功能区域,本研究采用缺失突变的分析方法,结果显示: ER1功能区域为117-317bp,而ER3功能区域为1~265bp。对ER1117-317和ER31-26s功能区域的原核转录因子及其结合位点在线软件预测研究发现:两个序列都有多个转录因子结合位点,其中ER31-265功能区域的转录因子及其结合位点皆较ER1117-317功能区域多。本研究成功地从样品基因组DNA中筛选出具有一定增强蛋白表达功能的3条增强子样序列,并对它们进行了序列分析,采用缺失突变的方法初步确定了ER1和ER3的功能区域,预测了功能区域的原核转录因子及其结合位点,为后期原核增强子样序列的理论研究和实际应用奠定了基础。
其他文献
按照现代先进的足球教学理论和方法,设计了技术教学中增加对抗因素的方案。通过两轮的教学实验证明:新方案不仅可以提高学生的实战能力,而且基本技术掌握优于传统教学法。
全面推进素质教育是党和国家加快实施科教兴国战略的重大决策,在高等教育中,人文素质教育不足是较普遍的现象.人文素质是大学生诸种素质的基础,它并非是天生的,而是人文知识
【摘要】近年来,我们国家的教育制度在不断的深化改革,改革后的高中数学内容上更贴近生活、更实用,教师的上课模式和教学方法也进步了不少,虽然现在新课程改革在一方面取得了很大的成绩,但是也有一些问题需要解决。根据高中数学教学中出现的问题,提出了一些解决问题的方法。  【关键词】高中数学 教学方法 创新思维  教育改革面临着新的问题,高中数学教师需要根据出现的问题调整教学方法,高中数学教学有许多问题,所以
<正>2007年高考宁琼卷和湖北卷在高考文学作品的阅读中选用了小说作为阅读文体,散文类文本一统天下的格局从此便被打破。近几年虽小说类文本进入高考卷的比重仍有增加,但散文
随着国民经济快速发展以及城市化水平的不断提高,特别是近几年来我国公路建设步伐明显加快,建设市场呈现出投资多元化发展,公路工程质量管理在当前经济快速发展的形势下显得尤为
目的:通过观察加味痛泻要方联合金双歧治疗儿童腹泻型肠易激综合征(肝郁脾虚型)的临床疗效及停药后复发率情况,评价其有效性、安全性。方法:选择64例年龄4岁以上14岁以下的腹
作为第一能源,煤炭资源在当前国民经济发展过程中起到了巨大的作用,为社会经济的可持续发展提供了重要保障。实践中我们可以看到,国内尤其是东部地区的煤炭矿区煤炭开发深度非常
目的:通过对腹泻型肠易激综合征患者临床调查,进行数据统计分析,总结出腹泻型肠易激综合征的中医证素分布规律,完善临床诊疗体系,以期对临床中医治疗、预防、减少复发提供个
高职院校在开展学生就业指导工作时,需要结合当前的就业形势,积极与企业建立合作关系,全面准确地获取社会职业需求信息,从而为就业指导奠定基础。高职院校应当积极引导学生树
25年前,邓小平同志以战略家的眼光,审视中国高等教育的改革,明确指出:"要制定加速发展电视、广播等现代化教育手段的措施,这是多快好省发展教育事业的重要途径,必须引起充分